Nvidea Xserver-setting は多分管理者で開かないと設定を保存できないのでは？（使っていないので、詳しくは分かりませんが）。
端末から、

gksu nvidia-setting

とやると保存で来たような気がします。

でも、電源を入れなおしたら、解像度が変わるのはちょっと分かりません。
システム→設定→モニタで、モニタの設定が出てきますので、その中にも解像度があると思います。どう認識されているか確認したほうが良いと思います。

解像度がおかしくなったのはやはり
私が設定を変えすぎたからのようで、
その後ＯＳが立ち上がらなくなりました。

その件は別トピックで質問し、
再インストをする事で解決致しました。

再インスト後言われたとおりの手順で
無事にNVIDIA X Server Settingsも
使えるようになりました。

どうも有難う御座いました。