Ubuntuで埋め込みMIDI(bgsound、embed)を鳴らす方法については、インデックス>>Tutorial & Tips内の
【HowTo】TiMidity++の基本的な使い方とちょっとしたTipsにて詳しく紹介しておりますので参考になさってください。

チェック項目としては
1)/etc/default/timidityの設定を確認する。
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# uncomment to override enabling triggered by availability of timidity-deamon
TIM_ALSASEQ=true

# Setting overrides (of /etc/timidity.conf) for the ALSA sequencer daemon
TIM_ALSASEQPARAMS="-Os -EFresamp=l -EFreverb=g,42 -EFchorus=s -s32kHz -p64a"
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特にMIDIの出力先を-Os (alsa)に設定すること

2)/etc/timidity/timidity.cfgの設定を確認する。
TIM_ALSASEQPARAMSで設定した内容と同じオプションが設定できていること。
(例)
opt Os
opt EFresamp=l
opt EFreverb=g,42
opt EFchorus=s
opt s32kHz
opt p64a
opt --realtime-priority=100
opt --sequencer-ports=1

# By default, try to use the instrument patches from freepats:
source /etc/timidity/freepats.cfg

3)/etc/mozpluggerrcの設定を確認する。
mozpluggerrcのオリジナルはAUDIO、VIDEOなど、沢山のメディアに対して設定がなされています。
mozpluggerrcにはMIDIに関しての記述のみにされるのがよいです。

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### Audio      ###
##################

audio/mid:midi,mid:MIDI audio file
audio/x-mid:midi,mid:MIDI audio file
audio/midi:midi,mid:MIDI audio file
audio/x-midi:midi,mid:MIDI audio file
    controls noisy stream: timidity -Os "$file"
    controls: playmidi "$file"

controls noisy stream: timidity -Os "$file"のMIDI出力先を alsaに設定すること

mozpluggerが正しく設定されたか確認する方法はfirefox 起動後 URL欄に about:pluginsと入力して
mozpluggerが上記code内の関連付けだけ表示されればＯKです。

以下は必要かどうかは利用者の判断で行ってください。
bgsoundはfirefoxでは処理されません。bgsoundをembedに置き換えるとfirefoxでも鳴ります。
この機能を追加するにはGreasemonkeyをインストールし、
bgsound2embed V2をインストールすることにより可能となります。