logicool wireless keyboard k270を使っています。
システムの設定から、左のctrlとcapsを入れ替えました。
しかし、emacsやterminal上で、ctrl+aやctrl+d、ctrl+kなどキーバインドが使えません。
Xmodmapからの入れ替えも試しましたが、やはりキーバインドが使えませんでした。

キーバインドは、入れ替える前のctrlでは使えました。

また、
システムの設定→キーボード→レイアウトタブ→「日本語」を選択→表示
から、キーボードの図を見て、各キーの様子を見てみましたが、入れ替えを行ったcapsキーだけが、押しっぱなしにしても、色が変わったままにならず、点滅をしていました。

ubuntuのバージョンは11.04です。