私のところではUnityが動かないので、Unity 2Dで確認した範囲となってしまいますが、
　・リストに「ibus-ui-gtk」を追加することでアイコンは表示される。
　・しかし、uim-toolbar-gtk*-systrayのサイズでは表示されず、最初のアイコン一つだけが表示される（実用になるとは思えない）。
といった感じでした。
ただ、私の中で「UnityとUnity 2Dの通知領域は微妙に仕様が異なっているのではないか？」という疑惑が渦巻いていますので、Unityでも同じなのかは不明です。

uim-toolbar-gtk3-systrayは（uim-toolbar-gtk-systrayをkillしてから）起動させると使えますので、まずは確認だけというのが良いかと思います。

補足情報ですが、uim-toolbar-gtk-systray が潰れて表示されるのは、
icewm や lxpanel でも確認しています。