お世話になります。

現状、deja-dupで週一で/homeディレクトリのバックアップをとっているのですが、月１くらいで
home以外もバックアップを採取しておきたいと思ってます。そのため、

１．適切なバックアップコマンドは何がいいでしょうか？
　(できればコマンドでcrontabで起動するようにしたい）
２．最低限どのディレクトリのバックアップを採取しておけばよいでしょうか？

　11.10→12.04へアップグレードした際、変な操作をしたらしく、最終的に12.04を新規インストールして
/homeだけはリストアしました。

　よろしくお願いします。