下記では「GNOME Shellを使う場合はGDMに変更します。これをしないと，セッションのロックができません。」とあります。
デスクトップマネージャをlightdmからgdmにしてはいかがでしょう。

http://gihyo.jp/admin/serial/01/ubuntu-recipe/0258?ard=1381489817

なるほど。
トリプルブートの環境で、rootなども消えてしまったのですね。。。

実は以前、私はunityからxfceに変更しました。
wht-dove様と同じ、12.04です。
誰からも回答が得られず、参考にはならないかも知れませんが、その時の質問が下記です。

https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=15172

いきなりunityを消さず、xfceを入れて両方とも使えることを確認してからunityを削除しました。
GUIでのログインができなくなりましたが、CLIでのログイン・操作はできました。
また、lightdmからgdmにしたところGUIでのログインもできるようになりました。


> Unityを削除する事で、こんな事になるのですか？

unityを削除してもよいのですが、その前にgnomeやgdmをインストールしてunityとgnomeの両方ログイン・操作できることを確認してから、unityを削除するとよいと思います。
私の場合はxfceでしたが、事前にunityの代わりとなるデスクトップ環境を入れてあれば「root, userのアカウントが消える」ということも無いはずです。

恐らくunityを削除した際に、何か必要なパッケージや設定ファイルも一緒に削除されてしまったのではないかと思います。


復旧が難しいようであれば、再インストールになるかと思います。
その際はgnomeやgdmをインストール・設定し、ログイン確認などをしてからunityを削除してみてください。