こんにちわ。

フォントのレンダリング設定等を色々と変えてみても
変化がありません。

というのはSystem->Preferences->Fontでしょうか。私はLCD上でIPAUIGothic 10, Subpixel smoothingで設定しています。通常想定される範囲であればフォント（サイズ）の変更ないしレンダリング設定の変更で対処できると思います。

ただ、Windowsに比べて文字の見え方が気になります。

これはWindows上の日本語の表示にアンチエイリアスがかかっていないせいではないでしょうか。ClearTypeが有効なフォント（メイリオなど）を設定すればWindows上でも同様の描画になると思います。