まず前提として、アラビア語（などの右から左に書く言語）を正しく表示できるかどうかはソフトウェアごとに異なります。
この機能をコンピューター業界的な表現では、「BiDi」（Bi-Directional）と呼んでいます。

入力に利用したソフトウェアが、

・BiDiに十分に対応していない
・BiDiにまったく対応していない

ということが考えられます。

で、伝統的にQtの方がBiDi対応に優れている傾向にあるので、Kubuntuを使うとある程度期待の挙動になるのではないでしょうか。