自己解決しましたので、まとめておきます。

症状
ubuntu12.04でアップデート中クラッシュ
メッセージは「バックアップデーモンがクラッシュした可能性があり、バックグラウンドでの処理ができません」
# sudo apt-get update　は 97%で停止し、返ってこない（＝エラー確認ができない）

関連症状
アップデートマネージャが起動しない
ソフトウェアセンターが起動しない
ubuntutweakのjanitorを実行しようとすると、tweakが終了する

解決方法

ここを参考に
http://laniusbucephalus.blog49.fc2.com/blog-entry-448.html

/var/lib/apt/lists/ 下の「テキストに見えるファイル」全削除
その後
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade

で正常な状態に戻すことができました。

以上、お騒がせしました。