SoundConverterを使ってみたら

Flac形式からMP3形式へ変換 SoundConverter
http://tenten909.blog.shinobi.jp/sound% … dconverter

CDからrippingと同時にresamplingするのちょっとわかりませんが、
一旦リップしたのをアップサンプリングするのなら、 SoX でできますね。
sox track01.wav -r 96k -b 24 test.flac
のような感じで。

CyberstormPPC による投稿:

ソフトウェアセンターで検索したら、かなり出てきてどれだかわかりませんでした…(´・ω・｀)

そのままの名前です。

sudo apt-get install sox

でインストールできます。

リッピングは私は abcde を使っています。cddbも変更出来るようですが、私は問題ないのでそのまま使っています。
abcdeでリッピング。
sox でアップサンプリング or mp3化ができます。

CyberstormPPC による投稿:

もしかしてCUI専用のソフトですか？

そうです。

たとえばカレントディレクトリ内の複数のflacファイルを96KHzにアップサンプリングする場合は、

for file in *.flac; do sox $file -r 96000 -b 24 ${file%.flac}_96KHz.flac; done

などとして実行します。