Documentationをよく読んで、.htaccessの内容を修正し解決しました。
AllowOverride ディレクティブの項目だけでは不十分でした。
認証関係なのでmod_authz_hostの項目をよく読むと
order deny,allow
deny from all
のような書式ではなくなっていました。Requireを使います。
order deny,allow--->不要
deny from all--->不要

allow from env=allowbot--->Require env allowbot
allow from ***.***.***.***--->Require ip ***.***.***.***

以下続く

Require ip  ***.***.***.***
Require ip  ***.***.***.***/24
など必要なもの
書き直したものを保存し再起動で問題が解決しました。