状況が変わりましたので質問を変更させてもらいます。
上記からWindowsのMBRですかね、の修復を再度してみるととりあえずUSB抜きでもWindowsは立ち上がるようになり、
USBを挿していてもセッティング画面のBOOT順をUSBとUbuntu をWindowsの上に持ってこないとだめです。（これは正常ですかね、USBの中にUbuntu があると思っておりますが、BOOTの選択肢にUbuntuがいるのも違和感です）
で、その状態でUSBを抜くとUbuntuを立ち上げようとしてかgrub＞のコマンド画面になって強制終了するしかできません。
liveUSBをつかって起動して、Boot Repairを使うことを成功できたのですが、正常に完了しました。と表示出ているのですが再起動をすると
再起動の無限ループに入ってしまいます、（おそらくUSBブート時）Lenovo表示後左上に小さく[reset system]と出ています。
USBを抜くと通常Windowsは起動できます。
Boot Repairが悪いのでしょうか、ちなみに一度再インストールをして問題なくUSBにインストールできたのですがBoot Repair使用後同じ現象になってしまいました。
一応この記事を参考に進めた結果です。
https://qiita.com/koba-jon/items/019a3b4eac4f60ca89c9
なにか改善の余地はあるでしょうかご教授お願い致します。

回答ありがとうございます。
そうです。今のとこ正しいかわかりませんがWindowsは問題なく起動できる状態にあります。
USBをを挿すとBOOT設定でWindowsの上にUbuntuとUSBを持ってくればUbuntuをUSBブートのように起動ができるのですが、
その状態ですとUSBを抜くとUbuntuを起動しようとしてエラーが出てる感じになります。
なのでUSBへBoot　Repairを使うと問題が解決するという事例もあったので使ったのですが
これもエラーがでるUSBへとなってしまいました。
他のところ等見ているとUEFI？MOK？そこらへんが怪しいと思っています。
最近のPCにはBoot　RepairのようなブートローダーをUSBに入れるのではなく、
UEFIでGPTやそこら辺の知識が必要だと思っています。現状で何ができるかを
調べているをいう状態にあります。