とりあえず、XDebugをインストールしてみました。
1)php5,php5-devをインストールしていなかったのでまずはインストール
　sudo aptitude install php5
　sudo aptitude install php5-dev
2)XDebugをインストールするにはpeclを使ってインストールすることにしました。
　それにはphp-configとphpizeがパスが通っていることが必要とのこと。
　早速確認。。。
　which php-config                        ---->OK
   which phiize                              ---->OK
3)以下のコマンドを実行
   sudo pecl install xdebug
4)php.iniを開く
  vi /etc/php5/apache2/php.ini
5)次の一文を追加
　(どこに書くのかわからないが、Dynamic Extensionsというところに書きました。)
   extension=xdebug.so
6)Apacheを再起動
　sudo apache2ctl restart

適当にphpコードを作成して表示してみたところ、ブラウザ表示でvar_dumpの箇所に
色がついて見やすくなりました。（以前は色がついていなくて見にくかったので）

IDEの設定も検討しているところですが、NetBeansでチャレンジを続けてもデバッグできず・・・。
お手上げです。。。(T T)   
とりあえず、エディタにviを使用してデバッグできるようにはなりました。。。

epiiさん

epii による投稿:

php5-xdebug というパッケージがあるので、そっちを使う方が設定とかは若干楽かもしれません。

あと Ubuntu では apache2ctl よりも /etc/init.d/apache2 を使うのを推奨しているらしいです。
どう違うのかは知りませんが…。

確かに過去にも「Ubuntuでは/etc/init.d/apache2 [オプションを]をapache2ctlよりも推奨しています」との
フォーラムがありますね。
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=5348
ただ、どうしてapache2cltよりも/etc/init.d/apache2を推奨するのかはわかりません。
理由は分からないけれど、とりあえず、apache2の起動や再起動は/etc/init.d/apache2を使うべきということで
認識しました。情報の提供ありがとうございました。

ry による投稿:

#5の eng16danboさん による投稿:

確かに過去にも「Ubuntuでは/etc/init.d/apache2 [オプションを]をapache2ctlよりも推奨しています」とのフォーラムがありますね。
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=5348
ただ、どうしてapache2cltよりも/etc/init.d/apache2を推奨するのかはわかりません。

件の「/etc/init.d/apache2 を推奨」の投稿をした本人です

推奨理由は、実際に /etc/init.d/apache2 の内容 (単なるシェルスクリプト、つまりテキストファイル) を見てもらえれば或る程度は理解できると思います
実際のところは、/etc/rc2.d/apache2 を直接実行するのと比べてもほとんど差はないのですが、Apache2 を再起動 (restart)するときに既存のインスタンスが確実に終了したことを確認していたり、mod_chache を使ったときのキャッシュの消去を行っていたりというように、細かな点に違いがあります

また、ubuntu の起動時に Apache2 も一緒に起動するようにしている (大抵はそうなっているはず) なら、これも /etc/init.d/apache2 start を実行すること (実際にはシンボリックリンクされている /etc/rc2.d/apache2) で実現しているので、整合性を取るためにも、直接 /usr/sbin/apache2ctl を実行しない方がいいといえます


若干オフトピ気味ですが、補足ということで

ryさん

わかりやすい解説ありがとうございます。
/etc/init.d/apache2の推奨理由についてよく理解することができました。
ありがとうございます。