自分の環境はImacです。BootcampでWin7も導入しています。
導入したのはKubuntuの３２ビットで、パーティションは「手動」で設定を行い、/dev/sda4にルートをExt4でフォーマットして作成しました。スワップ領域は作成しませんでした。
最後に拡張のボタンのところからブートローダのインストール先を/dev/sda4に変更してインストールを行いました。無事にインストールが終わって再起動したところrEFItに認識されずに起動できないというのが現状の状況です。つまり、ブートローダさえ起動できてません。一応、GPTとMBRのシンクは行ってあります。
実は、検索したところ本家フォーラムでまったく同様の状況の方がいたので参考に張ります。
http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1143937
このかたはGRUBをインストールすることで解決できたようです。LiveCDとかからコマンドでやったのでしょうか？
GRUB2が悪いのかその辺りもよくわかりません。どなたかアドバイスよろしくお願いいたします。