http://code.google.com/p/winff/wiki/UbuntuInstallation
のとおりに、
wget --quiet --output-document=- "http://winff.org/ubuntu/AAFE086A.gpg" | sudo apt-key add -
echo "deb http://winff.org/ubuntu karmic universe" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/winff.list
sudo apt-get update && sudo apt-get install winff
sudo apt-get install libavcodec-unstripped-51
sudo apt-get install libavcodec-unstripped-52

を実行すると、sudo apt-get update && sudo apt-get install winffの時点で
インストールに失敗したかと思うと、いくつかのアイコンが黒い四角のアイコンになったり、ホームへのリンクが切れたりしていて、
再起動してログインすると、デスクトップがマウスカーソル以外表示されませんでした。

セッション変更でGNOMEフェールセーフでログインすると、GNOMEが見つからないと言われました。

何か設定が書き換えられてしまったのでしょうか？