同様の問題でleylinesさんとは逆に左手側にマッピングできなくて困っていましたが試行錯誤の結果解決できたのでご報告します。
どうやら TopX,Y BottomX,Y はタブレット側のアクティブエリアではなく、モニタ側全体のエリアをマッピングする数値のようです。
つまり

    Option "TopX" 0"
    Option "TopY" "0"
    Option "BottomX" "40640"
    Option "BottomY" "30480"

で画面全体のマッピングを指定して、タブレット側の解像度が X,0-40640 Y,0-30480 なのでタブレット動作も画面全体にマッピングされてしまう、と
私の場合はWacom Intuos4 8x13なので必ずしもleylinesさんと同じ環境ではありませんが、以下の設定を 50-wacom.conf に追加することで左側にマッピングすることができました

    Option  "TopX" "0"
    Option  "TopY" "0"
    Option  "BottomX" "130048"
    Option  "BottomY" "40640"

8x13の解像度は X,0-65024 Y,0-40640 なのでディスプレイ側に倍の数値を指定したわけです。
また、

    Option  "TopX" "-65024"
    Option  "TopY" "0"
    Option  "BottomX" "65024"
    Option  "BottomY" "40640"

とすることでマルチディスプレイの右側にマッピングできる事を確認しました。
なぜマイナスなのか今ひとつわかりませんが、左端を通りすぎてループして右画面に繋がるって事なんでしょうかね？(^^;