Ubuntu Studioを使っているMocchiと言います。Jackは日常的に使っているので、少しはお役に立てると思います。私もUSBオーディオI/Fを使っていますが、残念ながらEdirol (Roland) のものではないので、それほど具体的なアドバイスはできないと思いますが、よろしくお願いします。

サウンドデバイスはこれですね。
Edirol UA-25 @ roland.co.jp

まさかとは思いますが一応念のために伺います。JACKの「connect」ウィンドウの「Audio」タブで、アプリケーションの出力をシステムの出力に接続してますよね？

その上で音が出ないというのであれば、Edirol UA-25のハードウェア側でのサンプリング周波数の設定値と、JACKにおける設定値を併せていない、とかが思い当たります。もっともこの場合、私のデバイスではトーンが狂ったノイズまじりの音が出力されますけれど。

こういうときはALSAのウェブサイト！！というわけで見てみたら、Edirol UA-25ってびしっとサポートされてるんですね。何かTipsが載っているかもしれません。

Edirol UA-25

ろくなアドバイスになっていませんが、参考まで。

質問内容でしたjackで音が出ない件ですが解決しました。

ubuntu studio 10.04 にALSA,JACK,FFADO関連を入れます。
qjackctlをroot権限で起動、その他のオーディオ系ソフトも同様にrootで起動しました。
その結果、alsa選択時にオンボード、USBオーディオでも設定したとおりに音を出すことが可能になりました。

ユーザの権限が関係するところでトラブっていたのかもしれませんが、問題点がどこだったのかについて
前の環境でのテスト等を行って確かめたいと思います。
なお、usbについてはUA-25のアドバンススイッチはON、サンプリングレートは44100Hzです。

また、ffadoを使っての出力がまだできていない状態です。
ffado-dbus-server,ffado-mixerは起動できておりますが、jackでfirewireを選択した場合にデバイスが選べません。
こちらについても何かアドバイスあればよろしくお願いします。

rootだとうまく行く理由ですが、どうやら.ffado配下のユーザがrootになっているためのようでした。
戻した所、通常起動で問題なく動作しました。

分かってしまえば初歩的なことですが、念のためご報告致します。