・・・？
普通に起動しましたが。（仮想デスクトップ１で。）
特に効果ないようです。
でも起動後に変更するって発想はなかったですね・・・
仮想デスクトップ間を移動するコマンドはないですか？
（私の勝手なイメージ）
仮想デスクトップ４に移動、
Sylpheed起動、
仮想デスクトップ１に移動。
これは不可能でしょうか。
あと、効果がでなかったのは、サイズ等を記憶しているからですかね？
（拡大化した状態で終了したら、次の時、自動で拡大化される。でも、仮想デスクトップの場所は記憶してくれていない。）

devilspie を使います。

sudo apt-get install devilspie
mkdir ~/.devilspie

導入したら、以下の内容の sylpheed.ds というファイルを ~/.devilspie 内に作ります。

(if
   (is (application_name) "sylpheed")
   (set_workspace 3)
)

gnomeの起動時に devilspie を予め起動させておきます。
これで 自動的にワークスペース3で起動するようになります。


なお、compiz や icewm などは devilspie を使用せずに簡単に設定することが出来ます。

新着メールのチェックが目的なら
   mail-notification : メール着信通知
が便利だと思います。

通知スペースやポップアップのメニューで教えてくれます。

pc944 による投稿:

できるだけ負担を避けたいので。
ほかに更に良い方法があれば、教えていただけるとありがたいです。
gekogekoさん＞evolutionを使うようですが、Yahooのポートとかの関係で、Sylpheedに変えたのです。
evolutionはもう消してしまいました。すいません。軽量化のためです。また仮想PCでやってみます。
（私は、WindowsよりもLinuxの方が速くできると信じていますから・・・）

であるならばgekogekoさんの言うように mail-notification のような新着メールの通知だけをするアプリケーションの導入の方がいいかと思います。evolution は関係ありません。

pc944 による投稿:

いや、依存で導入されるんです。evolutionが。mail-notificationの。

evolution を削除しちゃったのですか。あれはGNOMEの標準の一部なのでいろいろと問題が。今回のように。

mail-notification はevolutionと依存していません。mail-notification-evolution は依存していると思いますが。
http://packages.ubuntu.com/ja/karmic/mail-notification

考えられるとしたら標準のMUAの設定が evolution のままとかですかね。

# evolutionを削除すれば問題はないと思いますが、今後も同様の問題にぶち当たる可能性はあるかと。

・・・・上の写真（ちょっと見にくいですが・・・）のようになります。