ああ、↓ですよね。


画面の枠は表示されていますか？
表示されているなら・・・バグだと思います。まだ出来立てなので。
（とはいえ、Betaからバグはかなり減っています。初めは、毎回起動時にエラー報告作られるぐらいでしたし・・・）
それと、CompizやEmeraldを使っているなら、標準に戻してみてください。
改善するようなら、Compiz・Emeraldが問題を起こしていることがわかります。
改善しないのなら・・・Compiz・Emeraldは特に関係ないかと。
もしかして、Metacityのコンポジーティング機能、有効ですか？