yamaさん、どうやらそのようですね。
こんな事もあるんだなぁ、と少し驚きました。
と同時に、http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=456210　ここにgfloppyが入っているgnome-utilsが有ったので、これをインストールしたら自分で再構築したカーネル以外では問題なく動作しています。
自分で再構築したカーネルでは相変わらず、「開くデバイスが有りません」と云うようなエラーが出て困っています。

解決しました。
ずっとネット上で調べていたらhttp://ubuntuforums.org/archive/index.php/t-3494.html
このような例が有ったので、端末から sudo modprobe floppy としたら /dev/fd0 が作成されました。
そして /etc/modules に、新たに floppy を書き加えて再起動したら最初から /dev/fd0 が作成されていました。
どうやらフロッピードライブがモジュールとして読み込まれていなかったようです。

自分で再構築したカーネルのバージョンは 2.6.20.3-ubuntu1 です。
再構築するまで使っていたカーネルのコンフィグファイル /boot/config-2.6.20-16-generic をコピーして .config として使用したのですが、何かの整合性がとれなかったのでしょうか。
他にも /etc/fstab 内の記述に若干の修正が必要でした。
例えば、今まではCDROMデバイスを表す記述が /dev/hdc だったのが /dev/scd0 に書き換えることになったり、ハードディスクを表す記述も /dev/hdx から /dev/sdx に書き換えることになったりしました。
しかし、結局ハードディスクに関しては UUID で記述したので、ハードディスクの換装やパーティションの変更をしなければ今後のトラブルは無いと思っています。

今回のカーネル再構築は大変勉強になりましたので、新しいバージョンのUbuntuが出ても自分用にカーネルを再構築して使用したいと思います。
色々とありがとうございました。