hal の fdi を設定する方法がある様です。
http://sugi3.jugem.jp/?eid=66

xorg.conf での設定は、私には分かりませんが、
man xofg.conf すると楽しめるかも。

10.04ではhalの設定は効かないっぽいです。
しかもなぜかudevのrulesも効かないっぽいです。
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Hardware/HowToConfigureTrackball
を参考にしていただくとよいかも。
デバイス名はdmesgかxinputあたりで調べられるかと思います。ボタン名はxevで調べられるかと思います。
設定内容はxinputで試してから、設定内容をスクリプトにしてログイン時に実行するよう設定するか、確認した設定内容を/etc/X11/xorg.confに書いてください。

k2plan による投稿:

WindowsのNTFSの中にubuntu10.04をインストールしています。

復旧についてですが、上記よりwubiでのインストールをしているのではないかと思います。これは仮想HDDイメージをNTFS領域に作成しますので、普通は中身は見れません。
LiveCDからloopbackデバイスとしてマウントすることもできますが、それよりはUbuntuをRecoveryModeで起動して、root shellを起動して、/etc/X11/xorg.confを一度消してしまうのが簡単かと思います。

皆様、色々ありがとうございました。おかげで復旧及びトラックポイントの
スクロールの件は解決しました。

①復旧はリカバリモードで修正ファイルを元に戻しました。これが簡単ですね。
②10.04の場合は、トラックポイントの件
http://psung.blogspot.com/2010/04/thinkpad-trackpoint-scrolling-in-ubuntu.html
にありました。
簡単に書きますと

UbuntuのLucid/10.04に適用することができます。
/usr/lib/X11/xorg.conf.d/20-thinkpad.confに
内容は以下のとおりで作成します。

Section "InputClass"
    Identifier "Trackpoint Wheel Emulation"
    MatchProduct "TrackPoint"
    MatchDevicePath "/dev/input/event*"
    Driver "evdev"
    Option "EmulateWheel" "true"
    Option "EmulateWheelButton" "2"
    Option "Emulate3Buttons" "false"
    Option "XAxisMapping" "6 7"
    Option "YAxisMapping" "4 5"
EndSection


保存したら、再起動。
Gシリーズ、Xシリースでは問題なく動きました。

以上です。