社内からのため、認証が必要なproxyサーバー経由でインターネットにアクセスしようとしています。

しかし以下のとおり、一部アプリケーションで接続できない状況にあります。

アプリケーション−アプリケーションの追加と削除−＞407 Proxy Authorization Required
アップデートマネージャ　−＞OK
Synapticパッケージマネージャ　−＞407 Proxy Authorization Required

proxy接続で試したことは
システム−設定−ネットワークのプロキシーを設定
apt.confに以下を追記

Acquire {
http::proxy "http://ユーザ名:パスワード@IPアドレス:ポート番号/"
}

他にどのような設定が考えられますか。