質問とは違うコメントですが、homeやswapをUSBメモリに移すのって出来ると思うのだけどUSBメモリが無いと起動できない。
そういうのは選択肢に入るでしょうか？

kazuonakagawa による投稿:

最近、netbook editionなるものがあることを知りました。

これは、普通のものに対して動作が軽くなるだけでしょうか？
もしくは、OSに使う容量が少なくて、アプリケーションをインストールできる空き容量も普通のものより
多いのでしょうか？

どちらかというと普通のものより重い目のような気がします。Windows7対応クラスのNetbookでそこそこのGPUが入っていればまったく問題無いレベルですが。
ウィンドウの管理が少し変わっていて、常に最大化されていたり、アプリケーションの起動が通常のパネルから選択する方式ではなく、Netbook Remix特有のランチャから起動するなど、小さな画面でも操作しやすくすることを重視したUIになっているだけで、中身は基本的には通常のUbuntuと変わりません。
初期状態のアプリケーションの数は把握していませんが、インストーラ自体がかなり大きくなっていることを考えると、通常のUbuntuよりディスクの消費量は多い目なのかも知れません。

通常のUbuntuを再インストールされるのでしたら
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Install/CreateSeparateHomePartition
拡張デバイスにExt3,またはExt4でフォーマットした領域をホーム用、500MB〜1GB程をswapにします。

拡張デバイスを挿してインストーラーを起動してください。

インストール時にも作成できますが慣れていないのでしたら先にパーティションを作成した方が良いでしょう。
データ用としてWindows(その他の機器)等でも使用する場合はfat32の領域を確保しなければいけませんが、先頭のパーティションに作る必要が有ります。

現在インストールしているパッケージの再インストールには便利な方法があります。
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Application/PackageManagementSystem/SynapticPackageDownloadScript


再インストールでは無い場合やPC特有のインストール（イメージのコピー）でしたら手作業になります。
拡張デバイスのパーティショニングが完了しましたらパーティションの内容,USBメモリを挿した状態で
$ sudo fdisk -l

の結果を下さい。

/home以下を４GB、/rootを８GBという考え方自体、わかっていない初心者です。

Ubuntuではファイルシステム（XPでのCドライブと同意）の中の主要フォルダ（XPでのDocuments and Settings, WINDOWS等と同意）を別のパーティションやドライブに分けることが出来、起動時には一つに纏められて2対上のデバイスを一つのデバイスの様に認識して起動できます。

私としては主要システムは内蔵デバイスの４GBがのほうが良く思いますが逆もありですね。


蛇足ですが使用中のクリーンアップとしては

$ sudo apt-get autoremove
$ sudo apt-get autoclean

挙動としては別途お調べ下さい。

Ubuntuをインストールしなおすのであれば、
個々人の使い方やポリシーの問題なので、万人にとって最適なものは無いとは思いますが、
sda1(4GのSSD)を/に、
sdb1(8GのSSD)を/usrに
にしてインストールしなおせば、割と良い感じになるような気がします。
ほとんどの追加アプリケーションは、
/usr/bin
/usr/sbin
/usr/lib
/usr/share
以下に入るためです。

スクリーンショットはhir0さんが貼られた、リンク先を参照下さい。

「手動でパーティションを設定する」を選らんで、
パーティションを切り、
フォーマット形式(通常はext4が良いかと思います)を選択し、
マウントポイントを選択します。
ただしswapの場合はマウントポイントの選択はありません。

どのように切るのが最適か、kazuonakagawaさんの使い方に合ったものを考えてみるのがよいかと思います。
/には最低4Gは割り当てておいた方がよいかと思います(これでもアップグレード時は足りなくなってしまうかも知れません。その場合は一度パッケージをいくつか削除してからアップグレードするか、再インストールする必要がでてくる可能性もあります)。
安全を見るなら/に8Gぐらい割り当てた方がよいかも知れません。
(arrayさんはその辺りを心配されていたのかも、と今更ながら思いました)

また、ハイバネーションをする場合は、メモリの2倍程度、Swapを用意しておく必要があります。

/homeはデータは外部メディアに保存するとのことなので、あまり気にする必要は無いかも知れません。

アプリケーションのインストール先は先ほど書いたように、主に/usr以下です。
/usrに特別にパーティションを割り当てなければ/パーティションの中に作られるディレクトリであるため、/にはアプリケーションのインストール分込みで割り当てなければなりません。

私のメインPCはいろいろ詰め込んでいるので/usrだけで4Gほど使っていました。ご参考まで。

皆さん、たくさんのご教授、本当にありがとうございました。
ちゃんとご説明できないのですが、普通にインストールしたより
空き容量が多く、速度も早く、満足して使ってます。
本当にありがとうございました！！