蛇足ですが、

それから、モニタの自動調整機能を使うという記事もあったのですが、
windowsとデュアルブートしている都合上、
それを使うとwindowsでずれが発生するためなんとかubuntu側で解決したいと思っています。

この懸念は、モニターの基本機能を理解されてないからと思います。
モニターに記憶される同期の数はそのモニターの性能に依存しますが、少なくとも5つくらいは大丈夫と考えます。

私もdual bootでWindowsとUbunutuを利用していますが、当然解像度は相違しています。
起動画面から、その途中などすべて解像度は違っていますが、すべて同期してくれ正常に表示されています。

koisan1949 による投稿:

羨ましいかぎりの高性能モニターを使用されていますね。
1.ATI RADEON 9600のボードを利用しての出力にモニターが同期調整を適合させてないからです。
　モニターの水平同期・垂直同期の自動調整で問題なく動作します。
　要はモニターのAUTOSETボタンを押すだけです。それで記憶してくれます。今後は何もしなくても同期します。
2.疑問点
　マザー・ボードのグラフィックの機能の方が、ATI RADEON 9600のボードに比較して数段高性能ですが
　どうしてわざわざ旧式のATI cardを利用したいのですか。
　性能は、cardの例です。
http://pc.watch.impress.co.jp/docs/2007/1115/amd.htm

ATI RADEON 9600ボードを載せているPC、ATI RADEON HD 3800のボードを載せているPC、そしてマザーボードにオンチップのグラフィック(詳細不明)を使用しているPCの3台ありまして、それぞれubuntu系を入れて見た結果、ATI RADEON 9600ボードを載せたPCのみがズレを起こしてます。
マザーボードにオンチップのグラフィックがATI RADEON HD 3800という訳ではありません。
余談ですが、ATI RADEON HD 3800のボードを載せているPCも以前はATI RADEON 9800ボードを載せていまして、こちらもATI RADEON 9600ボードを載せているPCと同様に右にずれてしまっていました。
ATI RADEON 9800ボードが先頃使命を全うされて昇天してしまったことから、AGP接続で比較的新し目と思われるATI RADEON HD 3800に交換したところ、ズレはなく正常に表示しています。
ATI RADEON 9600ボードを新し目のボードに交換してしまえば解決してしまう問題ではあるのですが、やはり原因と対処方法を覚えない前にお別れしてしまうのもどうかと思いまして…。

それから全くの蛇足となってしまうのですが、モニタもそれまで使用していた平面ブラウン管モニタがこれまた使命を全うして昇天してしまったのと、地デジ化によりケーブルTVを導入することになったため、テレビモニタとPCモニタを兼ねるためこのモニタを奮発しました。
写真を扱うため画面が広くなって操作性が良くなったのと、地デジの美しさに感動したものの、PCに回る資金が…。

ご回答ありがとうございます。

$ xrandrの内容ですが、

Screen 0: minimum 320 x 200, current 1920 x 1200, maximum 1920 x 1920
DVI-1 connected 1920x1200+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 519mm x 324mm
   1920x1200      60.0*+
   1600x1200      60.0 
   1680x1050      60.0 
   1280x1024      75.0     60.0 
   1280x960       75.0     60.0 
   1152x864       75.0 
   1024x768       75.0     70.1     60.0 
   832x624        74.6 
   800x600        72.2     75.0     60.3     56.2 
   640x480        75.0     72.8     66.7     59.9 
   720x400        70.1 
DVI-0 disconnected (normal left inverted right x axis y axis)
S-video disconnected (normal left inverted right x axis y axis)

となっています。
それからご指摘の通り、現在の設定が1920*1200なので1680*1050などを試して見ましたが、画面が中央に縮小されるだけでした。

また、関連性があるかどうか分からないのですが、先ほどモニタの説明書を再度目を通していた時に、プリセット・タイミングという項目がありまして、解像度1920*1200の項目には、

VESA CVT RB 1920 × 1200
ドットクロック　154.0MHz
垂直同期周波数　59.95Hz
水平同期周波数　74.04kHz

という記載があります。
リフレッシュレート＝垂直同期周波数ということなので、カタログ値から現状設定が大きくずれていないのですが・・・。

どの辺が問題なのでしょうか？
よろしくお願いいたします。

ご回答ありがとうございます。

数日、時間を見ていろいろと弄ってみたのですが、

$　xrandr --output DVI-1 --mode 1280x960 --rate 75

で、画面が中央に小さく表示がされるものの、右端が切れないのが確認できました。
1920x1200で正しく表示させるにはリフレッシュレートを弄れば良い事が分かりました。
現在、参照URLの内容を必死になって理解している最中です。
それからモニタへの接続方法はアナログ端子で行っており、それで右にずれています。

未だ解決には至っておりませんが、まだ時間がかかりそうですのでとりあえずご返答までです。

よろしくお願いいたします。

Modelineを手動で弄るのは果てしなく破壊行為に近いかなと思いますので、どうしてもModelineを弄らなければならない場合は「xvidtune」を使ってください。
ただ、帰線期間を省略した数値を得られるのかはわかりません。

参考：http://kobuchicken.blog22.fc2.com/blog-entry-46.html
参考：http://xjman.dsl.gr.jp/man/man1/xvidtune.1x.html

ご回答、誠にありがとうございます。

新しい方法が提案されていましたので、早速試してみました。
しかし、調整バーを動かし、testのラジオボタンを押したところ、

「Sorry: You have requested a mode-line That is not possible, or not supported by your hardware configuration」

というエラーが出て調整ができませんでした。
このやり方ではダメなのでしょうか・・・。

それから、前出の方法での質問なのですが、
参考URLより、「ReducedBlanking」を使用する際には帰線期間を削ったモデルラインの計算結果が、「xorg.conf」のModelineの項目に記載が必要となると思うのですが、この計算方法はどのようにすれば良いのでしょうか？
少し検索はしてみたのですが、見つけられませんでした。

お手数をお掛け致していますが、よろしくお願いいたします。

ご返答ありがとうございます。

>「ATIからダウンロードした」ということは、「システム」メニューにある「ハードウェア・ドライバ」からはプロプライエタリなドライバを試していないということでしょうか。試されていない場合は先ずこれを試してみてください。

現状、なにも選択できない状況です。
別機、ATI RADEON HD 3800のボードを載せているPCにLinux mint9をインストールした際は、「プロプライエタリなドライバが使用できます」みたいな表示がでまして、問題なくインストールができました。
なぜ、ATI RADEON 9600ボードを載せているPCでは同様に行かないのでしょうか。

>上記でダメだった場合は、Windowsの方がツールが整っていると思いますので、"Windows側を変更する形" というのを検討してみてください。（ケーブルTVが絡んでくると問題でしょうか？）

デュアルブートしているPCだけならそれでも良いのですが、実は切替器でファイルサーバーとモニタを共有（前にマザーボードにオンチップのグラフィック(詳細不明)を使用しているPCと言ったものです）していまして、こちらも同じOSのubuntu9.10で正常表示していますので、異常表示側をモニタで自動調整してしまうと、Windows側、正常表示していたubuntuの画面が左にずれてしまい、結局がubuntuで画面調整を行わなくてはならなくなり、まさに芋づる式になってしまいます。
手持ちのPCにubuntu系Linuxを入れてみて、このATI RADEON 9600ボードを載せているPCだけが表示がおかしいので、このPCをなんとか調整して正しく表示させてあげたいと思っています。

それから、
>他、ATIのドライバーをインストールすれば直るという記事も見かけましたので、ATIからダウンロードしてインストールを試みたのですが、適合しない？みたいなエラーが出てしまって、インストールに失敗しました。
の件ですが、結論としては手順が間違っていた事に気がつきました。
インストールの前にカーネルソースをダウンロードしなくてはならないようですが、どれをダウンロードすれば良いのか良く解りませんでした。

このグラボは諦めた方が良いのでしょうか…。

ディスプレイ側がアナログ端子とのことだったので、リフレッシュレートが多少変更が効くはずだと思います。
60Hz以外の周波数をいろいろ試すと、正常に表示されるレートが見つからないでしょうか。
ただ気になるのが、

$ xrandrの内容ですが、

Screen 0: minimum 320 x 200, current 1920 x 1200, maximum 1920 x 1920
DVI-1 connected 1920x1200+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 519mm x 324mm

とのことでしたが、本当にDVI端子では無く、アナログ(D-sub端子)での接続でしょうか?

VGA端子(D-sub15)に接続しているのに、xrandrではDVI-1と表示されるのは不思議ですが、すいません、なぜそうなるのかについては判りません。
ちょっと引っかかる点はありますが、まずは、xrandrでリフレッシュレートを変えてみて下さい。
手順は、
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Hardware/HowToChangeMonitorResolution
を参照下さい。
Modelineの計算は、上記のWikiには詳細書いておりませんが、gtfコマンドを使って下さい。
$ gtf X解像度 Y解像度 リフレッシュレート
のような書式です。いくつか例示します。

$ gtf 1920 1200 55

  # 1920x1200 @ 55.00 Hz (GTF) hsync: 68.09 kHz; pclk: 175.40 MHz
  Modeline "1920x1200_55.00"  175.40  1920 2040 2248 2576  1200 1201 1204 1238  -HSync +Vsync

$ gtf 1920 1200 65

  # 1920x1200 @ 65.00 Hz (GTF) hsync: 80.99 kHz; pclk: 211.22 MHz
  Modeline "1920x1200_65.00"  211.22  1920 2056 2264 2608  1200 1201 1204 1246  -HSync +Vsync

$ gtf 1920 1200 70

  # 1920x1200 @ 70.00 Hz (GTF) hsync: 87.43 kHz; pclk: 228.02 MHz
  Modeline "1920x1200_70.00"  228.02  1920 2056 2264 2608  1200 1201 1204 1249  -HSync +Vsync

$ gtf 1920 1200 75

  # 1920x1200 @ 75.00 Hz (GTF) hsync: 93.97 kHz; pclk: 246.59 MHz
  Modeline "1920x1200_75.00"  246.59  1920 2064 2272 2624  1200 1201 1204 1253  -HSync +Vsync

makkun-s による投稿:

リフレッシュレートを55・65・70と試してみました。
結果、リフレッシュレート値を高くする度に幅が狭くなり、70の時点でモニタ本体からのエラーが出ました。
ですので、75は試していません。

幅が狭くなるというのはPCが認識する解像度は変わらなくて、モニタの表示上、端が真っ暗で残るようなイメージでしょうか。もしそうであれば、もうちょっとそのあたりを詳しく説明願えますでしょうか。
また、このとき縦方向の表示は正常でしょうか。

最初の投稿で

makkun-s による投稿:

画面が右側に、上下のスクロールバーが半分位隠れる位ずれています。

とのことでしたが、このとき左側はどのようになっていますでしょうか。
右側がずれている分くらい、真っ暗になって残っている感じでしょうか。
それとも、ぴったり左端から表示が始まり、右側にはみ出す感じでしょうか。

また、下記をxrandrで試してみるとどうなりますでしょうか。

$ gtf 1920 1200 59.61

  # 1920x1200 @ 59.61 Hz (GTF) hsync: 74.04 kHz; pclk: 191.90 MHz
  Modeline "1920x1200_59.61"  191.90  1920 2048 2256 2592  1200 1201 1204 1242  -HSync +Vsync

(水平を74.04kHzに合わせて微調整)

ダメでしたか。リフレッシュレートが60Hz以外でおかしな挙動になるなど、本当にDVIちっくな挙動を示すのですね。。
先に出力先がDVIと表示されているのをなんとかしないといけない気がしてきました。
$ man radeon
してみたところ、関連しそうなものとしては、

Option "IgnoreEDID" "boolean"
              Do not use EDID data for mode validation, but DDC is still  used
              for monitor detection. This is different from NoDDC option.
              The default value is off.

などがあるようです。そちらでは/etc/X11/xorg.confにはなにか記述していますでしょうか。

お世話になります。ご回答ありがとうございます。

>そちらでは/etc/X11/xorg.confにはなにか記述していますでしょうか。

/etc/X11にxorg.confというファイルはありませんでした。

>一応、帰線期間を省略しただけのModelineも試してみますか？

早速試してみました。
・・・ところが、新しいモデルライン「1920x1200R」を登録したまでは良かったのですが、なぜか「1920x1200R」に切り替わりません・・・。
(見た目は変わらず、既存の「1920x1200　60」の所に「*」が付いたままとなります。)
その他のモデルラインには切り替わる、また、新しく「1920x1200_55」を作成したものも切り替わるので、私の手順が悪い訳ではないようですが・・・。

やはり、VGA端子接続なのにDVI接続と表示される辺りが原因なのでしょうか。