「Ancient Version」つまり古いバージョンですよということですが、
synapticを見るとubuntuの最新のようです。
これはどういうことなのでしょうか？

質問1：
「ubuntuに採用のバージョンは古い」と受けとってもまちがいないのでしょうか。

http://gtk-gnutella.sourceforge.net/en/?page=news
によると、最新バージョンは0.96.6のようなので、それほど古くもないようです。

質問２：
それからこういったp2pのソフトについて法律が制定されたそうですが、
gtk-gnutella は違法になりそう？です。

そのような法律が制定されたという話は聞いたことがありませんが、情報源はどこでしょうか。

1. インストールしただけでも違反？
2. インストールは良いが、起動させたら違反？
3. アプリ起動は良いが、具体的に「著作権の関係ないものも含めてダウンロードを開始」したら違反？
4. アプリ起動は良いが、具体的に「著作権ありのものをダウンロードを開始」したら違反？
5.（3）を開始しても良いがダウンロードを完了したら違反？
6.（4）を開始しても良いがダウンロードを完了したら違反？
7. あるいはgtk-gnuterraでのダウンロードはまったく違反にならない？
以上　教えてください。

法律には詳しくないので、参考程度に読んでいただきたいのですが、現時点の日本の法律では、1～6は「違法」にはならないのではないかと思います。道義的な問題は別として。
ただし、ダウンロードしたものを転送する際、場合によっては公衆送信権の侵害になる恐れがあるのではないかと思います。くどいようですが、法律の専門家でもなんでもないので参考程度に読んで下さい。
個人的にはLinuxを使う人間には権利と義務にセンシティブであっていただきたいと願っているので、他者の著作権を侵害するおそれのある行為は極力さけていただきたいです。
ダウンロードしても大丈夫、と思うものだけダウンロードして下さい。
なお、判例等々は調べていません。

※補足
　Winny 作者の金子さんは第二審の高裁で無罪を勝ち取りました。検察が上告するかどうかの情報はまだ得ていません。
　参考：[url]http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0910/08/news031.html[url]