Ubuntu 13.04でも同様の問題でご相談しましたが，13.10でも悩まされています。
お知恵拝借です。

環境：
インプットシステム：Ibusを選択しています。
インプットソース：English(US)とJapanese(Mozc)の二つです。

現象：
メニューバー上のキーボードインディケータ−：ログイン直後はMozc表示；クリックしての表示切替はできる。
Ctrl-Spaceによるインプットソース切替：できる。

ところが，メニューバー上のキーボードインディケータ−が変化しません。

状態が変化しないキーボード・インディケータ−は，その名に値しません。
現在のキーボード・インディケータは約立たずです。
どこかに何らかのインディケータがないと，インプットソースがUSかMozcかがやってみないと分からないのは不便です。

Ctrl-Spaceでキーボード・インディケータの表示を切替えることはできるのですか。
なのに私ができていないのは，設定のどこに原因がありそうですか。
設定に関わらず，これがもしできないとしたら，これに代わるインディケータが何かありますか。

助言を期待します。