si による投稿:

注意するとすれば、カレントディレクトリと上位ディレクトリを表す、”.”と”..”で処理をしないことくらいでしょうか？

for x in *
do
  echo $x
done

で確認したら、”.”と”..” は、出てきませんでしたね。
失礼

siさん、何度も回答ありがとうございます。実は最初にアドバイスを頂いた際に、cdコマンドで上の階層に戻るようにコードを書いてみました。いろいろ試行錯誤の末、cd ..はないほうがいいのではないかとも考えていましたが、今考えなおすとご指摘通りないとだめですね。
改めて改善したコードが以下です。まだ問題点があります。

for a in $(ls -F | grep /)
do
    `cd "$a"`
    for b in $(ls -F | grep /)
    do
        `cd "$b"`
        for c in *.flac
        do
            ARTIST=`metaflac "$c" --show-tag=ARTIST | sed s/.*=//g`
            ALBUM=`metaflac "$c" --show-tag=ALBUM | sed s/.*=//g`
            TITLE=`metaflac "$c" --show-tag=TITLE | sed s/.*=//g`
            TRACKNUMBER=`metaflac "$c" --show-tag=TRACKNUMBER | sed s/.*=//g`
            mv "$c" "$ARTIST - $ALBUM - `printf %02g $TRACKNUMBER`.$TITLE.flac"
        done
    cd ..
    done
    cd ..
done

これを実行すると、また大量に印字されるので途中で実行を中止するとホームディレクリにいました。この現象から想像するに、cd $aコマンドやcd $bがうまく実行されず、cd ..コマンドだけが実行されていると考えられます。
なぜcd $aなどのコマンドがうまくいかないかを考えてみました。自分の至る結論はやはり空白ごとに区切って引数になっているということです。少し状況の説明が不足していたので以下に詳細を書きます。

実行結果のログを見ると、"The"というディレクトリに移動しようとして、そのようなディレクトリがないとエラーが返されています。これは、"The Beatles"というアーティスト名のディレクトリがあり、それを変数aとしてcdコマンドの引数とする際に、cd The とcd Beatlesというように2つのコマンドに別れてしまっていることが原因と考えました。

この現象を防ぐためにバッククォーテーションを使ってみたのですが改善されません。もしこのコードの問題点が指摘した部分であれば、正しい表現をアドバイスいただければと思います。
もしその他にも問題点がありましたら、そのご指摘もしていただければと思います。

STGSAGWANさん、回答ありがとうございます。参考に、というよりもほとんどそのまま自分の環境に当てはめて実行してみました。

find . -type f -name '*.flac' | while read f
     do
    ARTIST=`metaflac "$f" --show-tag=ARTIST | sed s/.*=//g`
        ALBUM=`metaflac "$f" --show-tag=ALBUM | sed s/.*=//g`
        TITLE=`metaflac "$f" --show-tag=TITLE | sed s/.*=//g`
        TRACKNUMBER=`metaflac "$f" --show-tag=TRACKNUMBER | sed s/.*=//g`
    d=$(dirname "$f")
        mv "$f" "$d/$ARTIST - $ALBUM - $TRACKNUMBER.$TITLE.flac"
     done

for文でうまく行かなかった理由が未だわからないままですが、while文にすることでうまく行ったようです。本当に回答ありがとうございました。満足行く結果が得られました。

ここまでで十分なのですが、実はSTGSAGWANさんの回答を参考にしている際に、間違えて変数dなしで実行してしまいました。結果、見事にカレントディレクトリに希望通りのファイル名にリネームされたファイルの数々が作られました。mvコマンドをよく理解していなかったからですね。いくつかカレントディレクトリに移動されていないファイルもあるのでそれがよく分からない点ですが、今後理解していこうと思います。また、間違えて移動してしまったファイルを元のディレクトリに戻すコードも考えてみます。もしこれを見かけたかたで良い案があれば意見いただければとも考えていますが、まだ試行錯誤もしていない段階なので、問題が起きたらまた質問させていただきます。今回はsiさん、STGSAGWANさんともにありがとうございました。

dd による投稿:

自分の至る結論はやはり空白ごとに区切って引数になっているということです。

空白文字は、デリミタになるので
for a in $(ls -F | grep /)
等とすると、word 単位に分割されてしまします。
こういった場合の、回避策の、１例です

#!/bin/bash

for a in *
do
  if test -d "$a"
  then
    cd "$a"
    pwd
    cd ".."
  fi
done

katsu07さん、siさん回答ありがとうございます。最初に結論から書くと、全てうまく行きました。回答して下さった皆さんは、自分でコードを書きたいというわがままに答える形でヒントのみを与えて下さり、物分かりの悪い自分にイライラしていたかもしれませんがようやく解決です。

今後同じ問題にぶつかった方のためにも、備忘録としても書き込みを頂いてからの試行錯誤を記載しておきます。まずkatsu07さんの書き込みを見て良い案だと思いました。しかし問題もありました。flacファイルに情報をタグ付けした際に、データベースの情報を利用するとcdによって同じアーティストでも大文字小文字等の表記が異なる場合があり、自分でディレクトリを作り統一するという作業をしていました。そのためタグの情報とディレクトリ名が少し異なるファイルがいくつかありました。そのためechoコマンドを使うというアドバイスは大いに活用させていただくとして、他の戦略をとることにしました。

siさんの書き込みを見て、諦めかけましたが、なんとか実現出来ました。挙げていた言語だとruby、schemeを齧ったことがありましたが、本当に触りだけなので自信がありませんでした。しかしターミナル上でできる自信はありました笑。一度ディレクトリを全て削除し、タグの情報を元にディレクトリを作り直し、移動するという手順をとりました。ディレクトリの削除はGUIで行い、ディレクトリの作成、移動は以下のコードで行いました。

find . -type f -name '*.flac' | while read f;
do
    ARTIST=`metaflac "$f" --show-tag=albumartist|sed s/.*=//g`
    ALBUM=`metaflac "$f" --show-tag=album | sed s/.*=//g`
    mkdir -p "$ARTIST"/"$ALBUM"
done

find . -maxdepth 1 -name "*.flac" -type f | while read f;
do
    ARTIST=`metaflac "$f" --show-tag=albumartist|sed s/.*=//g`
    ALBUM=`metaflac "$f" --show-tag=album | sed s/.*=//g`
    mv "$f" "$ARTIST"/"$ALBUM"
done

まとめて一つのwhile文にできますが、うまく行くか少し不安でこのような形にしました。このコードを作るまでにechoを使う手法で何度か確認もしました。結果は大成功でした。今回はsiさんをはじめ多くの方に助けていただき、希望通りのリネーム及びターミナル上でのファイル、ディレクトリの扱いに慣れることができました。本当にありがとうございました。