いつもお世話になっています、siraseです。

Ubuntu 12.04 LTS以降から、従来のLinuxの常識である /etc/resolv.conf にDNSサーバを
書くという設定方法から、dnsmasqを使った実装に切り替わっていると思います。
Webを見るとあちこち混乱もしているようなのですが、ここで整理したく思います。
また、私自身わからない点もあるのでご教示頂けませんでしょうか？

まず、Ubuntu Server版だと

/etc/network/interfaces

に

iface eth0 inet static
               address 192.168.3.3
               netmask 255.255.255.0
               gateway 192.168.3.1
               dns-nameservers 192.168.3.45 192.168.8.10
               dns-search foo.org bar.com

といった設定を記述すれば、問題なくDNSサーバの設定が出来てこれが正攻法(Ubuntu 12.04 LTS以降の
作法に従った設定方法)だと思います。
それ以前は /etc/resolv.conf に直接書くので問題ありませんでした。
上記設定は

$ man resolvconf

のマニュアルの中に書いてあるものをそのまま引用しています。

Server版についてはこれで良いのですが、問題はDesktop版です。
Desktop版の場合はNetworkManagerがGUIで提供されています。
当然GUIで
　　・Static IPアドレスが設定できる
　　・DNSサーバのアドレスが設定できる
と認識しています。
しかし実際には、NetworkManagerのGUIツール上でDNSサーバのアドレスを設定しても
そのDNSサーバを参照してくれずに目的の正引きが出来ない事が多々あるかと思います。
その問題については、
　　・/etc/resolv.conf がシンボリックリンクになっているから普通のファイルにしてしまう
　　・/etc/NetworkManager/NetworkManager.conf の dns=dnsmasq をコメントアウトしてNetworkManager再起動
　　・dnsmasqを完全に削除する
　　・/etc/resolvconf/resolv.conf.d/base にDNSサーバのアドレスを書く
等色々情報が錯綜している状態かと思います。
やりたい事は下記です。
　　・Static IPアドレスを設定
　　・DNSサーバを設定
上記を、設定ファイルを直接修正する等せずにGUIのみでやる方法はありますでしょうか？
せっかくNetworkManagerが提供されているのに、結局は設定ファイルを直接編集しないといけないと
なると、もはやNetworkManagerが使い物にならない気がします。
/etc/network/interfaces をいじってしまうと、NetworkManagerとの整合性が取れなくなりそうです。

・完全に設定ファイルベースで設定(Server版みたいなやり方)し、GUIのNetworkManager等は無効化する
・完全にGUIのNetworkManagerで設定して設定ファイルは直接いじらない

のどちらかで一貫しないと、整合性が取れなくなりシステムが汚い状態になると思っています。

Ubuntu Desktop版における、正しい設定方法、お作法とはどう設定する事でしょうか？
Tips的な方法ではなくオフィシャルな設定の仕方を知りたいです。

以上、ご教示のほどよろしくお願い致します。