ドライブに物理的な問題があるのかもしれません。
答えになってませんが、一般的に

オンラインのosアップデートは勧めません。

私はオンラインのosアップデートを何回かしたことがあり、失敗したことは皆無です。でも勧めません。今回、12.04から14.04への更新は一台成功しましたが勧めません。

その理由は、時間が膨大にかかり、かつほっておけないからです。色々訊いて来て答えないといけません。数時間子守をしなければなりません。it may take hoursと言われ、実際、2時間以上かかりました。

データのバックアップ、ブラウザのブックマークのバックアップ、メーラーの設定ファイルのバックアップ、その他よく使うソフトの設定ファイルバックアップを取れば、クリーンインストールしてバックアップを戻せばそちらの方が短時間ですみます。