先日 ubuntu 12.04 から 14.04 32bit にアップグレードしたところ，標記の問題が生じました．
詳細は，以下の通りとなります（冒頭のカッコは，作業を行うマシン）．

1. (ubuntu 14.04) gnuplot 4.4.3にて，epsファイルを作成する．
2. (windows 7)     adobe illustrator CS5 にて，1で作成したファイルを，illustrator CS5 eps 形式で保存する．
3. (ubuntu 14.04) 2で保存したファイルを evince 3.10.3 にて読み込む．
4. (ubuntu 14.04) フォントなどを除き，1のファイルと同等の表示が期待されるが，実際には画像背景が黒くなる．

ハードウェアは，
cpu: intel Core i7-3770S CPU @ 3.10GHz x 8
グラフィック: intel Ivybridge Desktop x86/MMX/SSE2
メモリ: 7.6 GiB
の構成です（システム設定 -> 詳細 からの転記です）．

なお，gnuplotで作成したファイルは，問題なく読み込むことができています．
また，以前のバージョン(12.04, 13.10)においては，上記の問題が生じないことは確認しております．

windows のソフトウェアも含むので，質問の場としては異なるのかもしれませんが，ご容赦ください．
その場合は，適切なフォーラムを教えていただければ幸いです．

よろしくお願い致します．