Ubuntu 14.04 (日本語 Remix) を使用しております。

ソフトウェアの更新(update-manager)において、
「このコンピューターのソフトウェアは最新です」
と表示される状態であるにもかかわらず、
端末から apt-get upgrade を実行すると
「以下のパッケージはアップグレードされます」
と更新対象が表示されることがあります。

apt-get よるアップグレードを保留しておくと、
翌日〜数日後には update-manager へ反映されるのですが、
中にはいつまでも反映されないパッケージもあります。

# 例えば現時点では "unity-settings-daemon" というパッケージが、
# いつまでも update-manager で更新対象になりません。

そこで２点質問です。

(1)このように両者で更新時期や更新対象に違いがでるのはなぜでしょうか？

(2)ソフトウェアの更新(update-manager)のみの運用では、
更新対象になるまで時間がかかったり、更新対象にならないものがありますが、
セキュリティ的に問題はないのでしょうか？

なお「システム設定→ソフトウェアとアップデート」の[アップデート]タブでは
以下のように設定しています。

  o 重要なセキュリティーアップデート
  o 推奨アップデート
  x プレリリースされたアップデート
  x サポートされていないアップデート

  アップデートの自動確認：毎日
  セキュリティアップデートがあるとき：すぐに表示
  その他のアップデートがあるとき：すぐに表示

以上、よろしくお願いいたします。