単純に、設定（スパナと歯車のマーク）ーディスプレーから、設定できませんか。
仮想環境からではダメなんでしょうか？

もしXorg.confを編集するなら、現在はそのファイルが存在しませんので、作成することになります。
ルート権限で作成すれば有効になります。
手順としては
xraddrで使用可能な解像度を調べて、
それをXorg.confに反映し指定することになります。
詳細は私の下手な説明より、
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Hardware/HowToChangeMonitorResolution
を参照してください。

何度もすいません。
よく読み返してみると質問者の意図と関係のない回答のような気がします。
無視してください。

みなさま、書き込みありがとうございます。
機能の夜一部試してみました。

> uotoraさん
それだと、対応しているアプリケーションのみが反応し、たとえばfirefoxだとコンテンツ部分は拡大されますが、アドレスバーは大きさが変わりません。 
個々のアプリケーションではなく、画面に表示されるものを一律一定の倍率で拡大したいです。

> shingenさん
設定メニューからはディスプレイという項目はありませんでした。
どこかをいじれば出てきますか？
Xorg.confは、リンク先にあったxorgのwikiを読みながら進めてますので、まだちょっと効果があるかどうかはわかりません。
関係あるかはわかりませんが、進めてみます。

> nussba_tmさん
VNCはどうしようもなかった時の手段として試させていただきます。ありがとうございます。

他にもすぐにできる方法があればぜひ教えてください。
宜しくお願い致します。

UBUNTU-MATE なので同じか解りませんが、
コントロールパネル - 外観の設定 - フォント - 詳細 - 解像度 かな?

適切なグラヒックスドライバーが適用されていないようです。
「システム設定」→「ソフトウェアトアップデート」→「追加のドライバー」で少々時間が掛かりますが、適切なドライバーを表示してくれます。
複数個表示されたら、1個選択し適用をクリックすれば改善されるかと思います。

> uotoraさん
残念ながら、「利用可能な追加のドライバーはありません。」と表示されました。

> favicon.icoさん
その方法だと、確かにタイトルバーとかは再起動したら変わったんですが、肝心のコンテンツ部分がおっきくなりませんでした。
firefoxで言えば拡大機能で130%ぐらいにすればまあ見られるかなという感じなのですが、
他の拡大機能のないツールだとうまくどうしようもなくて困っています。

あと、どこが問題なのかわかりませんが、再起動するたびに前回の1.25倍になっているみたいで、
どんどん大きくなってしまいます。

> masatsuneさん
ご回答ありがとうございます。解像度を変更した結果は#10でした。
他になにかあれば、是非教えてください。