ボタンのレイアウト変更のことでしょうか。
14.04 trusty については分からないのですが、
以前のものでしたなら、dconf や gconf を用いて
変更していました。その際のメモ書きがあります。
ただ、14.04 でも、設定エディター(gconf-editor) が
利用できるかは不明です。

「gconf-editor を入力し、apps --> metacity --> general で
button_layout を menu:minimize,maxmize,close に変更」

14.04 trusty からは、metacity はもうサポートされてないようでした。

gnome flashback (gnome tweak tool) / classic や Cinnamon などのセッション。
12.04 precise 上では有効でも、LinuxMint 17 Cinnamon (14.04) 上では動作
しなかった、ウィンドウの装飾のやっかいな Emerald Window Manager の系統も
選択肢になったりするやもしれません。Emerald は少しあぶなっかしそうですが。

gsettings set ... でも Ubutu Tweak でも無効なようで、これといった Unity の
ままでの解決策、変更方法は聞こえてきませんね。

検索しただけですが、ubuntu 14.04のunityでは現状できない様です。
今までは[org.gnome.desktop.wm.preferences]に設定を追加する事で制御されていましたが、ubuntu 14.04のunityではunity内部で決定されてしまっている為、unity-tweak-toolやubuntu-tweakでも制御できない様です。

unity-tweak-tool側のバグ
https://bugs.launchpad.net/unity-tweak- … ug/1309942
unity側のバグ
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+sour … ug/1309964

ubuntu-gnome14.04では、defaultでアプリの閉じるボタンが右側です。
最大化・最小化のボタンは、Tweek Toolのウィンドウの項目のところでONにすると出てきます。
好みは別れる所かもしれませんが、けっこうオシャレでUbuntuとWindowsの
いいとこ取りのようなデスクトップです。
ヴァーチャル環境ででも一度おためしあれ。

再度クリーンインストールをしてみました。
そしてgnomeやgnome flashbackをインストールしましたがダメ。
ubuntu-gnomeをインストールして、ログアウト、ログインをしたら右になりました。
gnomeとubuntu-gnomeは別物なのですね。勉強になりました。