1、は？？です。私の環境では、そのような現象が起こらないので・・・
２，言語バー→辞書のアイコン・・・単語登録
　Dashホーム→Anthy辞書管理からの二通りあります。
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/JapaneseEnvironment/IbusAnthy

追加です。
MSIMEで作成した単語登録をAnthyに取り込む事ができます。
MSIMEのツールからデータを出力。
出力したファイルをUSBメモリにコピー
Anthyの言語バーのスパナのアイコン⇒辞書⇒追加・・・MSIMEの出力したファイルを選択

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