書き忘れました。
リサイズできるウィンドウなら全てです。特定のウィンドウに限った現象ではありません。

すみません。いろいろ試したら全てのウィンドウではありませんでした。
２つ３つダメだったので全部だと勘違いしてました。
いくつか載せます。
いいもの
virtualbox、clipgrab、skype、pictbear(wine)、soundconverter、audacity、easymp3gain、google chrome、firefox、opera、vlc、k3b、dvdstyler
ダメなもの
nautilus、ソフトウェアセンター、synaptic、プリンタ設定画面、ubuntu tweak、gnome-search-tool（ファイル検索）、gedit、brasero、端末、cheese
何か共通点でもありますかね？・・・
「ubuntu14.04 window resize slow」でも検索してみましたが、よくわかりませんでした。

現在gnome-panel：gnome flashback(metacity)で使用してます。
なので？compiz設定は関係ないようです。設定しても違いがありません（わかりません）でした。
気がついたことがあります。
リサイズしようとドラッグしたままだと反応が遅れるんですが、マウスから指を離すとすぐリサイズします。
ドラッグしたままでリサイズができると、表示中に限りあとはスムーズです。