質問させていただきます。

Windows 7で使っているパソコンへUbuntu16.04をインストールしたいと思います。 インストール先はSDカードです。
HDDのMBRは書き換えないようにする方法はありますか。


●できたこと
Ubuntu 14.04LTSをSDカードにインストール
BIOSでSDカードを起動指定(F12)、GRUB経由でUbuntuの起動に成功
（内蔵スロットからの起動対応）

●問題点
BIOSでHDDから起動指定すると、黒画面（メッセージ失念、「●●●>」のようなもの）となり、起動できない
SDカードを起動して、GRUBでWindowsを選択すると起動できる。
→Windows修復ディスクのコマンドプロンプトから、「bootrec /fixmbr」実行で直る


同一HDDへのインストールの場合、トラブル時やUbuntu再インストール時を乗り越える自信がありません。
そこで、UbuntuはSDカードへインストールし、Windows 7とUbuntuの切り替えはBIOSの起動選択から
行いたいのです。

思いつくやりかたは、HDDを物理的に除いた状態でインストールする、修復ディスクを再度使用する、ですが、
より良いスマートなやり方はありますか。