recoll 1.21.5
でskipped pathに　~/.*
を入れてると
インデクス作成時に
Bad paths in configuration file:
/home/xxxxx/.*
というwarningが出ます。

https://bitbucket.org/medoc/recoll/issues/273/bad-path-error-when-excluding-paths-with
index作成自体には問題なさそうです。
ご報告まで。