ご回答、ありがとうございます。
ubuntu-desktop（8.04）をインストールして試してみましたが、
残念ながら状況は変わりませんでした。
http://farm3.static.flickr.com/2154/2453919044_b7da6fc5ba_o.png

うーん、何が原因なんだろう…orz

ご回答ありがとうございます。
なるほど、そう言う理由があったのですね。

とりあえず、教えて頂いたリンク先にあった
”別の動画プレイヤーを動かした状態で、目的の動画プレイヤーをキャプチャする”
と言う方法で上手くできました。
http://farm3.static.flickr.com/2052/2454477188_be056eb048_o.png

なお、余談ですが、
WebBrowserで表示しているものは、
別の動画プレイヤーを動かしていなくてもキャプチャできますね。
これは何か表示方法が違うのでしょうか？
http://farm3.static.flickr.com/2051/2454477334_8547f7f1ef_o.png

ともあれ、目的の動作が達成できました。
ありがとうございました。

”Xウィンドウ・システム（Xv なし）” を選択すると、
別の動画プレイヤーを動かさなくてもキャプチャできますね。
それ以外はやはり黒抜けでした。
（”カスタマイズ”は、ちょっと意味がわからなかったので未確認です ^^;; ）

ご回答、ありがとうございました。