おそらく今回の質問内容はubuntuとは直接関係が無く、rubyの質問のように思われます。
私もrubyにあまり詳しいわけではないのですが、therubyracerというgemは環境によって差が出やすいライブラリだった気がします。

http://blog.skylarking.me/2016/12/09/nokogiri_therubyracer_libv8_error
http://suu-g.hateblo.jp/entry/20121222/1356189597

こちらの記事等を参考いただければ問題解決のお手伝いになると思いますので、ご確認してみてはいかがでしょうか。