家では

・メイン機のデスクトップ(Gutsy -> Hardy)では、くろっくさん同様
ネットワークマネージャーの警告文が表示され、Ubuntuのロゴが途中から表示され終了します。
警告文は通常の大きさの表示です。

・サブ機のラップトップ(Hardy新規インストール)では綺麗に終了画面が表示されています。
このラップトップは Gusty -> Hardy アップグレード時にはくろっくさんとまったく同じ状況で
ネットワークマネージャーの警告文が「これでもか！」という大きさで表示され終了していましたが
新規インストールし直したところ正常に表示されるようになりました。

アップグレード、新規インストール or 搭載グラフィックカード(チップ)によって
この辺が変わるのではないかと感じていますが・・・

かねてよりの問題解消ができました。

Ｕｂｕｎｔｕどうでもいい小技集　http://www.geocities.jp/ubuntu555/index.html

に記載されていた方法だと終了時に変なメッセージが出なくなり、
変なメッセージがでてるけど大丈夫なのかと不安な気分がなくなりました。

今は起動画面と同じような表示になってすっきりです。

（抜粋）
○8.04LTS（hardy）のシャットダウン（終了）時のエラーメッセージを見たくない。ぜひ解消したい！

１．これぞ決定版か！？
「システム」→「システム管理」→「ソフトウェアソース」をクリック
管理ユーザのパスワードを聞くダイヤログが出るので, 初期ユーザのパスワードを入力。
「ソフトウェアソース」のダイアログが開いたら「アップデータ」タブをクリック。
中ほどの「プレスリリースされたアップデート（hardy-proposed）」にチェックして閉じました。
（もし、パスワード入力用のダイアログが開いたら、初期パスワードを入力。「OK（O)」をクリック。）
アップデートが開始する。場合によってクリックが必要なダイアログがでるので終了まで見守る。
アップデートが終了すると「再起動が必要です」とダイアログが出るので、「すぐに再起動（R)」をクリック。
一切メッセージが出なくなり、起動開始と同じ画面がでました。
気分がすっきりしました。

あと、目的を達成したあとは、「プレスリリースされたアップデート（hardy-proposed）」が
どういう存在か分からないので、とりあえずチェックをはずして閉じました。
（抜粋終了）