Ubuntu Studioを使っていないのですが、
ちょっとオーディオミキサーがDAW付属のものなのか、単体のjack_mixerやNon Mixerかわからないので答えようがない気します。
LinuxのDAWならArdourやReaperやQtractorやZrythmなどもありますし...

もう少し詳しい情報がほしいです。

情報ありがとうございます。
私も、今使っているオーディオミキサーの名前が分かると良いのですが・・・
すみません。
でも、ミュートは、出来ます。
ちゃんと動作します。
ただ、単にボタンの表示がおかしいように思えるのです。
画像は、こちらにも、掲載しています。
https://qiita.com/masaru21/questions/4165a763f26a7dd523e1

ボタンをクリックできますし、動作します。
そのため問題ないと言われたら、それまでです。
でも、アイコン見づらいので、アイコンの表示を改善できたらと思っています。

アプリはPulseAudio Volume Controlのようですね。
コマンドではpavucontrolで起動できます。
私の環境でもミュートボタンは非常に見にくくなっています。
あまり気にしていないのですが、どうしても気になるようならGTKのテーマを変更してみてはどうでしょうか。
デスクトップにGnomeではなくXfceを使っているので違っているかもしれませんが、gnome-tweakでできるような気がします。
コマンドだと下記の方法でアプリケーションが使用するテーマを変更できます。

$ GTK_THEME=Adwaita:dark  pavucontrol

参考：https://www.linuxuprising.com/2019/10/how-to-use-different-gtk-3-theme-for.html