手持ちの光学ドライブつきノートパソコンで試し、成功しました。
ガイドによる自動設定でも、手動設定でも問題なく暗号化できました。

ハードディスクを暗号化する機能は7.10-AlternateCDで提供されていましたが
今回、8.04-AlternateCDでハードディスクを暗号化することができました。
皆さんの参考になれば幸いです。

手動設定にあたっては
このサイト（英文）で紹介されている、デジカメで撮ったダイアログ画像がとても参考になりました。
■Installing Ubuntu 8.04 with full disk encryption « Learning in Linux
http://learninginlinux.wordpress.com/2008/04/23/installing-ubuntu-804-with-full-disk-encryption/
　

ノートパソコンは、CPU:Pen_M, RAM:1GB, 20GBの内蔵ハードディスクです。
起動途中でパスフレーズを入れて利用します。
HDDが暗号化されていないUbuntuとの使い勝手の違いは、今のところ何も無いです。
暗号化による速度の低減とかはほとんど感じません。
シャットダウン状態で暗号化されているので、こだわるならサスペンドなどは使わないのが基本らしいです。
インストール後の構成はこのようになります。

●ガイドによる自動設定
・物理的な１つのハードディスク全てを書き換えます。
・/dev/sda1  /boot ext3  暗号化されません。255MB
・/dev/sda5  / と swap を含む暗号化LVM 　root: 18.9GB, ext3  swap: 872.4MB

とてもよくできたインストーラなのでしょう。案内もほとんど日本語で表示されます。
暗号化設定に関しては自分でやる設定もほとんどなく、迷わないのでは。
インストール過程の『ディスクのパーティショニング』で
------------------------------------------------------------------
方法：
・ガイド - ディスク全体を使う
・ガイド - ディスク全体を使い、ＬＶＭをセットアップする
・ガイド - ディスク全体を使い、暗号化 ＬＶＭ をセットアップする
・手動
------------------------------------------------------------------

この中の ガイド- 暗号化 ＬＶＭ を選択すれば、自動的に
パーティション（sda1, sda4(sda5)）を構成し
暗号化ボリューム（sda5_crypt）を作成し
ＬＶＭの論理ボリュームを設定（/dev/mapper/sda5_crypt）してくれます。

気をつけることは、ここで要求されるパスフレーズはユーザー用のものではなく
暗号化されたsda5を解除させるためのパスフレーズだということと、
日本語キーボード・レイアウトで「む」キー印字の記号(]と})を正しく認識しなかったので
注意することぐらいでしょうか。

パスフレーズの設定ページだけが、全文英語のままでした。
主な内容は
アルファベット・数字・記号を使って20文字以上にすることがオススメだということと
パスフレーズを忘れるとデータを復活することはできないので、メモを取るなり注意しましょう
というようなことだと思います。

日本語キーボード・レイアウトは、次の過程である『ベースシステムのインストール』を経ると
正しく認識するようになり、『ユーザーとパスワードのセットアップ』過程では何ら混乱しません。

テキストベースのインストーラということで、
Tabキーや矢印キー、spaceキーにEnterキーを使って設定をしていきます。
何度かUbuntuをインストールしたことがあれば
テキスト表示でも何とかなるのではないでしょうか。


●手動による設定
ＬＶＭを一度も扱ったことが無いのですが、それでも設定することができました。
それだけ、インストーラの出来がいいのだと思います。

ハードディスクがすでに sda1, sda4(sda5) となっていたので、今回そのままの構成でやりました。
例えば、インストール前の構成がsda1, sda4(sda5, sda6) となっていた場合、
sda6 は以前のままデータを残すとか、通常の手動によるインストールと同じようにできるはずです。
手動なので柔軟にできます。

最初に
パーティショニング設定後のテーブルを示します。
表示位置はもっと見やすく揃えられているのですが、実際にこういう内容で表示されます。

LVM VG west, LV home - 10.1 GB Linux device-mapper
    1. 10.1 GB f ext3    /home
LVM VG west, LV swap_1 - 1.1 GB Linux device-mapper
    1. 1.1 GB f スワップ    スワップ
LVM VG west, LV sysroot - 8.6 GB Linux device-mapper
    1. 8.6 GB f ext3    /
暗号化ボリューム (sda5_crypt) - 19.7 GB Linux device-mapper
    1. 19.7 GB K lvm
SCSI 1 (0,0,0) (sda) - 20GB ATA I2CXXXXXXX（固有ナンバーです）
    1. 基本 255.0 MB  F ext3  /boot
    5. 論理 19.7 GB  K 暗号化 (sda5_crypt)

　
作成順序は下からになります。ステップが進むにしたがって表示が増えていきます。
文章だけで書いてもわかりにくいと思いますが、大まかに流れを説明します。

マークの説明 （ヘルプより）
K: パーティションがすでに初期化されていることを示します
F: 初期化済みのパーティションを初期化する場合
f: それ以外の初期化の場合

a) sdaの設定
sda1を /boot として利用する設定を行う
sda5は『暗号化の物理ボリューム』指定する。データの削除も『いいえ』から『はい』にする。
（この状態ではまだ暗号化されないので『非活性』と表示されます）

b-1) 暗号化されたボリュームの設定
この文言が表示されるので、このステップを選択してa)の初期化を実行します。←ここがわかりにくい
sda5をフォーマットするのに時間がかかります。（数分〜）
パスフレーズを設定します。
これで、sda5の暗号化準備作業が終了し、『非活性』が 『(sda5_crypt)』 と表示を変えます。

b-2) 暗号化されたボリュームの設定
続けて、暗号化ボリューム (sda5_crypt) を初期化します。
この時注意しておくべき点があります。
暗号化ボリューム (sda5_crypt) 19.7GB Linux device-mapper は、
1. 19.7 GB F lvm ではなく、
1. 19.7 GB F ext3
と初期化されるのです。自動的にext3に初期指定されるから。
なので、ext3 から『ＬＶＭの物理ボリューム』に変更し、lvmに設定し直す必要があります。
暗号化設定が終了したので、LVM設定に移ります。

c-1) 論理ボリュームマネージャの設定
ＬＶＭの設定に入ります。
/dev/mapper/sda5_crypt (19747MB)

c-2) 論理ボリュームマネージャの設定
・ボリュームグループの作成
『ボリュームグループの作成』とは想像上のディスクドライブの作成であり、１つ作ります。
ここでは名前を west としてあります。
VG: Volume Group

c-3)  論理ボリュームマネージャの設定
・ボリュームグループデバイスの選択
デバイスは先ほどの /dev/mapper/sda5_crypt (19747MB) を指定（選択肢もひとつ）

c-4)  論理ボリュームマネージャの設定
・論理ボリュームの作成
『論理ボリュームの作成』とは想像上のパーティションの作成であり、ここでは
sysroot, swap, home と３つのＬＶを論理ボリューム名・論理ボリュームサイズと、
順次作ります。8GB, 1GB, 残り全部, と指定しました。
LV: Logical Volume

c-5)  論理ボリュームマネージャの設定
・論理ボリュームの設定
上記３つのLVについて、それぞれファイルシステム(ext3)や、マウントポイント(/home)等
通常のパーティショニング作業と同じ設定を行います。a)での設定と同じやり方です。

これで終了なので
『パーティショニングの終了とディスクへの変更の書き込み』を選択・実行します。
この項目は画面によく表示されていますが、
最初に上↑で示してあるように、テーブル作成が完了してから選択・実行します。


●8.04LTS AlternateCDのインストールプロセス

Ubuntu インストーラメインメニュー　（主なもの）

　　：
・最初にハードウェア関係の確認作業
　　↓

・ディスクのパーティショニング
・ベースシステムのインストール
・ユーザーとパスワードのセットアップ
　　：
　　：
・インストールの完了
　　：
　　：
・インストールの中止
　

インストールが完了すれば、再起動して終了になります。

このあと、さらに Japan Team 作成の日本語関係のソフトを入れるための設定を行います。
システムとデータの暗号化された日本語ローカライズド版が簡単に利用できます。
オススメは自動ガイドです。試してみてはいかがでしょうか？