gishotanさん、EeePCのことは現物もみたことないので、知りませんが、
　また、間違っていたらごめんなさい。

　/etc/X11/xorg.confの編集ですが、確かに最初はxorg.confだけです。
　画面設定をする毎に、xorg.conf.１ xorg.conf.2 ．．．．．と増えていきます。
　
　最初の内は貴君と同様な症状がでました。そこで、沢山増えたので、試しに
　バックアップを削除して、xorg.confとxorg.conf.1だけにして、
　その両方とも内容を同じに編集したところ、私の場合は正常になりました。
　その後は、設定を変更してもバックアップは増えますが、一応まともに動作
　して現在に至っています。
　確かに現況の設定が反映されるのは、xorg.confですが。。。
　理由は、私には理解出来ません。私も逆に、教えて欲しいところです。

　ｐｓ．
　「システム管理」-「モニタとグラフィックスカード」の「機種」を
　「Plug 'n' Play」に変更されているのが要因かもしれないです。
　モニタを自動判定して、起動する毎に設定するモードになっている可能性が
　あります。モニタとグラフィックスカードを何か問題のない固定した機種に
　設定するとよいかもとも思います。

最後の編集者: koisan1949 (2008-07-14 10:09:49)

eeePCとのことですが
http://forum.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=2081
こちらはもうご覧になりました？8.04もeeePC用が出ているので　そちらを入れればいろんな不具合が解消されると思いますが　　ってeeepC用でないという前提ですが

gishotanです。　ごめんなさい。　ubuntu-eee_v1.0 でした。訂正します。

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最後の編集者: kiyoshi (2008-07-15 06:12:18)

hardyさん　ありがとうございます。
　そう．．．、そのように書いてありますねぇ。「もし書換えて、再び自動的に更新されるようにしたいなら次のようにコマンドを打ちなさい」と。
　つまり、手で書換えたら、自動的には更新されないよ、ということですね。私はそういう意味だと乏しい英語力で考えたのです。ネットであちこちに書いてある仮想的な解像度の設定についての記事でも、xorg.confの変更のしかたについて触れていても、それが一時的な設定だとは書いていないし．．．
　ところが実際には、書換えた内容は次のリスタート時一回だけで有効で、その次のリスタートからは何か別の内容に更新されてしまうのです。　要するに一回は書換えた内容のとおり働いてやるが、どこか気に入らないからその次からはシステムが気に入るように勝手に更新するよ、ということなんでしょう。
　まだ勉強中で分からないのですが、「では、システムが気に入ってくれる仮想的な高密度表示の方法は何か」ということですが、もう一つ一回は書換えたxorg.confどおりに表示してくれるのですから、「その次のリスタート時にも内容が更新されないようなスクリプトが何処かに書けないか」というkoisan1949さんやkiyoshiさんのアイデアもあるわけですね。姑息(失礼)ですが、確かにこれは私がつかみたい藁でもありますね。

kiyoshiさん　親切におっしゃっていただいたのに返事が遅くなって済みませんでした。実は可能な限り皆様からのお話をヒントにして自分で解決策を見つけたいと思って悪戦苦闘をしておりました。で、kiyoshiさんの「/etc/init.d/rc.localに埋め込めるかもしれません」をヒントに、そうか、望みどおりに動いてくれたときのxorg.confをバックアップしておいてこれでシステムを起動するごとに/etc/X11/xorg.confを上書きするよう/etc/init.d/rc.localに書けばよいかも．．．と考えて、
cp /etc/X11/xorg.conf.back /etc/X11/xorg.conf
を付け加えたりしていました。
こういう変わったことをやると将来別の都合でxorg.confをいじることがあったときには、邪魔になる、とは思いますが今回の件に限れば特効薬のように見えました。
ところが、こうして立ち上がったＸは思い通りではなく、640x480の低解像度にしかなりません。xorg.confを覗いてみると、これは間違いなくバックアップしておいたものと同じです．．．。ならば何故？　というわけですが、気を取り直してここでAlt+Ctrl+BackspaceをしてＸだけを起動しなおすと、今度は「モニターとグラフィックスカード」に1024x768や800x600などの仮想解像度が現れました。
今では「電源を投入してＸを含むシステム起動」→「Alt+Ctrl+BackspaceでＸだけの起動」という２ステップを踏みますが、安定的に仮想解像度の画面が使えています。Linux初心者の私にとってはまだ納得できないのですが、ま、いいか、ということで。
kiyoshiさん、みなさん、ありがとうございました。