私はVMPlayer2.0.4を使用していますがが、XPとubuntuのマルチブート環境でどちらのホストOSからも使えています。
正解かどうか判りませんがゲストOSのシステムを作成する時に仮想ディスク（.vmdkファイル）を２Gバイト単位にスプリットしたら起動出来ました。確かVMWare serverだと設定画面にその指定があると思うのですが。
但し、XPとubuntuではドライブ表記が違うのでその都度修正するか確認されます。面倒くさいので、.vmxをXP用とubuntu用の作って.vmxに都度コピーして使っています。

VMPlayerだとQEMUで行うのが一般的のようですが、私ではQEMUでどのようにスプリット出来るか判らなかったものですから、VMWare serverのパッケージにあるvmware-vdiskmanagerというプログラムを使ってスプリットしてます。

それと理由は忘れてしまったのですが、Windowsシステム側でゲストOSを置いてあるパーティションをFAT32で作成してます。NTFSでもうまくいくかは記憶にありません。
ご参考になれば。