たぶん Ｋｙｌｉｘは KDEのアプリじゃないでしょーか ?

だとすると, scim-bridge-client-qtパッケージをインストールすると動くカモです。
(通常のものは GNOME版の scim-bridge-client-gtkのはず)

# Ｋｙｌｉｘ使っていないので, ググってみて KDEっぽいと思ったけど確証はなかったりして …

私の環境でもこの症状は再現しました。
フォント設定ダイアログでフォント設定後、及び、ファイル保存ダイアログでファイル指定後にキーボードからの入力できなくなりました。
暴走しているわけではなく、マウスでの操作はできるので一度終了し再立ち上げで復帰は可能です。
私の環境は
Ubuntu Ver 8.0.4.1 Ja_JP.UTF-8ロケール
インストール直後の素の状態です。
動作アプリは、鍋田辞書Linux版　Ver 3.48.1
開発環境は、Turbo Linux 10F.. でkylix3 C++
同じようにUbuntu Ver 7.0.4では症状は出ませんでした。
フォント設定後に入力できなくなる症状は、Ubuntu以外のディストリでも出た記憶があります。
(よく覚えていませんので後でまた確認します)
Anthyを切ったらでなくなるかどうかはまだ試していません。

kylixはKDEアプリではないと思います。
kylixのCLXは古いバージョンのQtベースですが、最新のQtとは独立していると思います。

バイナリ自体の互換性は同じx86系のLinux同士ならあると思います。
スタティックリンクしたりsoファイルを同梱すれば私の経験上は他のディストリでも動いています。
ディストリ依存するコードが含まれていれば挙動は起こりますが。