Ubuntuではソフトウェアをコンパイルしてインストールする必要は通常ありません。

シナプティック（ないしapt-get/aptitude)がソフトウェアの管理を行います。必要なソフトウェアを選ぶだけで基本的な設定・他に必要なソフトウェア（依存関係）などの面倒を全てみくれます。シナプティックに含まれていないソフトウェア（レポジトリに含まれてないといいます）の場合にはソースからコンパイルする必要もありますが、知名度の低いソフトやごく最新のものを試したい場合以外は問題ありません。

perlであれば当然レポジトリ（シナプティックで扱えるソフトウェアのリスト）に含まれています。シナプティックで検索していただければわかりますがperlのバージョンは5.8.8-7です。よってこのバージョンで問題なければチェックするだけでインストールできます。

これが基本的なソフトウェア導入の流れですのでご理解ください。WindowsではソフトウェアはダウンロードかCDでインストールとなりますがUbuntuの場合はその必要がありません。これはほとんどのソフトがフリー・オープンソースなので、Ubuntu用に調整した上でそれを勝手に配布してよいためです。自由に配布していいのですから、わざわざダウンロードしたうでどこにインストールするかなど指定せずとも、ボタンひとつで適切な場所にインストールできるようにしてあるというわけです。

この点は、Ubuntuの最大の利点といっていいものだと思います（特にインストールが複雑なソフトウェアの場合には重要です）。

bash: ./configure: No such file or directory

これはいまいるディレクトリにconfigureがないということです。pwdで場所を確認するかlsでconfigureがあるか見てください。