Hardyを再インストールしたのですが、Firefoxで日本語のフォントがおかしくなりました。

症状は、漢字や句点のフォントがIPAモナーフォントではなく別の明朝体（たぶん東風）に置き換わって表示されます。
ほとんどのページで起こります（例えばこのフォーラム）が、起こらないサイトもあるようです。（例えば http://unnnunnnet.blog47.fc2.com/blog-entry-94.html ）。漢字でも例えば「変」や「観」などは大丈夫のようです。

Firefoxのフォント設定は、JapaneseのサンセリフがIPAモナーPゴシック（16pt）、セリフがIPAモナーP明朝、モノスペースがIPAモナーゴシック（16pt）です。サイト指定のフォントを許可しなくても起こります。Westernはデフォルトのままです。

システムのほうの外観の設定もIPAモナー系を使うようにしたからかどうかわかりませんが、タイトルバーではちゃんとIPAモナーゴシック（UI?）で表示されているようです。

今書いてて気づいたのですが、句点や括弧のフォントは直前の文字に依存して変わるようです。（このフォーラムはスクリーンショットを貼れましたっけ？）

こちらの症状に近い気がするのですが、ヒンティングの設定には依存しませんでした。
http://forum.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=931

試しにIPAフォントをインストールしてみたのですが、（dpkg -i opfc-modulehp-ipafont-source_1.1.1+1.0.0-0ubuntu0ja1_all.deb） Firefoxの設定には現れませんでした。これはこれでおかしいのかなとも思います。他にも、VLゴシックなどに変更してみましたが、Firefoxの表示に反映されません。

前のインストールのときはちゃんとできていたのに、設定を残しておかなかったのが悔やまれます。
どういう設定にすればよいかご存知でしたら教えてください。