私も何か簡単な方法があれば知りたいです。

他のマシンから ssh でログインできればある程度犯人を特定できるかも。
ログインできたら怪しいプロセス(firefox や X)を殺してみて、それで復帰
するならソフトウェアの問題の可能性が大きいと思います。
(原因はそのソフトだけでは無いかもしれませんが）

私の使っている環境だとごく希に fluxbox が原因でキーボード操作が一切
できなくなることがあります。
それと、一週間に１回程度の頻度で原因不明のフリーズ(ping すら通らない)を
起こすマシンが１台あるのですが X を立ち上げず放置しておいても起こり
原因不明。何のログも残らない。こいつは BIOS のアップデートやメモリ,
ハードディスクのチェック、交換も効果無しでした。
(全く同じ構成の別マシンは平気だからなんとなくマザーボードの様な気はし
ますが）
カーネルのデバッグとか出来るスキルの持ち主なら何か分かるかもしれない
けど私にはお手上げ。