sudo grub-install --recheck /dev/fd0
でどうでしょう。
上記でダメであれば
/boot/grub/device.mapに(fd0) /dev/fd0の1行を追加してgrub-installの実行。

自己レスです。なぜ、フロッピーディスクをフォーマットしないで、ブートディスクをつくろうとしたか思い出しました。
ブートディスクの作り方説明ページ
https://wiki.ubuntulinux.jp/UbuntuTips/Others/UseBootRemovableDevice
に
＞予めフロッピーディスクをフォーマットしておく必要はなく、自動的にフォーマットされ、grubが書き込まれる。
と記載され、
＞対象とするUbuntuのバージョン * すべて
と書かれていたからでした。

jackalope による投稿:

フロッピーをドライブにセットしてmountする。
grub-install --root-directory=/media/floppy0 /dev/fd0

お世話になります。
「端末」で実施しました。結果は下記：

masayukiya@masa2:~$ sudo grub-install --root-directory=/media/floppy0 /dev/fd0
[sudo] password for masayukiya:
Probing devices to guess BIOS drives. This may take a long time.
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
Unknown partition table signature
The file /media/floppy0/boot/grub/stage2 not read correctly.
masayukiya@masa2:~$

フロッピーディスクを開くと中身は下記のようになっています。

/media/floppy0/boot/grub/default
/media/floppy0/boot/grub/device.map
/media/floppy0/boot/grub/e2fs_stage1_5
/media/floppy0/boot/grub/fat_stage1_5
/media/floppy0/boot/grub/jfs_stage1_5
/media/floppy0/boot/grub/minix_stage1_5
/media/floppy0/boot/grub/reiserfs_stage1_5
/media/floppy0/boot/grub/stage1
/media/floppy0/boot/grub/stage2
/media/floppy0/boot/grub/xfs_stage1_5

これでブートフロッピーは出来たのでしょうか？
追記：
このフロッピーディスクで起動してみましたが、いつものブート画面になったのでブートフロッピーが機能したのか、ブートフロッピーが機能したのではなく、HDDが通常どおり起動したのかはっきりしません。バックアップをとったサブHDDがエラーで起動しないときに試すことにします。有難うございました。

最後の編集者: masayuki (2009-04-10 16:03:02)

jackalope による投稿:

mkfs -t ext2 /dev/fd0 を実行しましたか？

いいえ、フォーマットしました。もう一度、そこからやりなおしましたが、grub-install後の表示でやはり
　　The file /media/floppy0/boot/grub/stage2 not read correctly.
と表示されました。

・・・ブートしてみれば分かります。

BIOSの設定でfirst, second, third boot device共、removable　で　boot other device を　disabled　にすると起動しませんでしたが
boot other device を　enable　にすると起動しました。
こういった起動をしたことがないのでわかりませんが、後者の場合、HDD（正常な）を読みにいって起動したのでしょうか？
現在、バックアップ用のHDDはRAWコピーしたのでこちらも正常に起動します。「差分コピー」だとこれまで　grub loading error 17となり起動しませんので、次回バックアップ時、「差分コピー」して、ブートディスクを試してみます。（コピーは「LBコピーワークス１０を使っています）
有難うございました。また、結果をかかせていただきます。

最後の編集者: masayuki (2009-04-10 19:04:06)

The file /media/floppy0/boot/grub/stage2 not read correctly

フロッピーをマウントしていないとこのエラーがでますね。しかし、エラーがでるとファイルの書き込みもしてないのですがね？？

最初からやり直してみましょう。
sudo fdformat /dev/fd0
sudo mkfs -t ext2 /dev/fd0
sudo mount -t ext2 /dev/fd0 /mnt
sudo grub-install --root-directory=/mnt /dev/fd0

こういった起動をしたことがないのでわかりませんが、後者の場合、HDD（正常な）を読みにいって起動したのでしょうか？

#5にも書きましたが、このフロッピーからブートした場合はGrubのメニューは表示されず、grub>のプロンプトのみになりますので自動でUbuntuは起動しません。

Grubのフロッピーを作る他の方法。

その1
mountまでは同じ。
sudo mkdir -p /mnt/boot/grub
sudo cp /boot/grub/stage1 stage2 /mnt/boot/grub/
sudo grub
root (fd0)
setup (fd0)
quit

その2
sudo dd if=/usr/lib/grub/i386-pc/stage1 of=/dev/fd0 bs=512 count=1
sudo dd if=/usr/lib/grub/i386-pc/stage2 of=/dev/fd0 bs=512 seek=1
このフロッピーはマウントできません。

追記：
コピー元FHDDのmenu.lstとコピー先のmenu.lstの中身を見比べましたが、違いはないようでした。
コピーソフトのテクニカルサポートに聞いたら、「コピー先HDDのGrubの更新が必要だかUbuntuについては分からない」と言っていました。
追記２：
コピー元HDDのフォルダgrubをコピー先HDDにメールで移して、/boot/grubにファイルをコピーしましたが、何故か、下記のように xfs_stage1_5だけコピー出来ませんでした。コピー操作自体有効だったか自信はありません。
masayukiya@masa2:~$ sudo cp default device.map e2fs_stage1_5 fat_stage1_5 installed-version jfs_stage1_5 menu.lst menu.lst~ minix_stage1_5 reiserfs_stage1_5 stage1 stage2 xfs_stage1_5
[sudo] password for masayukiya:
cp: target `xfs_stage1_5' is not a directory
masayukiya@masa2:~$ sudo cp xfs_stage1_5 /home/masayukiya/grub/ /boot/grub
cp: cannot stat `xfs_stage1_5': No such file or directory
cp: omitting directory `/home/masayukiya/grub/'
masayukiya@masa2:~$
このあと、フロッピーをはずして再起動したら、
　boot from:CD
  grub loading stage1.5.
  grub loading, ....
  error17
となり、起動出来ませんでした。

最後の編集者: masayuki (2009-04-12 08:58:56)

jackalope による投稿:

・・・menu.lst、error17、boot from:CD、コピー先HDDのGrubの更新、どの問題から解決したいのですか？

お世話になります。
お陰様で、ブートフロッピーからUbuntuが起動するまでになりました。
現在、ブートフロッピーから起動すると通常のブート画面がでて、ここからUbuntuは起動しますが、XPはerror２５となり起動しません。また、Ubuntu もブートフロッピーからしか起動できません。出来れば、「差分コピー」後、コピー先HDDで一旦ブートフロッピーからUbuntuを起動して必要な操作をおこない再起動すれば、それ以降、ブートフロッピーなしでブート画面からUbuntuにもXPにも入れる方法があれば教えてください。よろしくお願いします。

jackalope による投稿:

Ubuntuが起動したらsudo fdisk -lの結果とmenu.lstの内容をお知らせ下さい。

お世話になります。下記がその内容です。よろしくお願いします。

masayukiya@masa2:~$ sudo fdisk -l
[sudo] password for masayukiya:
omitting empty partition (5)

Disk /dev/sda: 160.0 GB, 160041885696 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 19457 cylinders
Units = シリンダ数 of 16065 * 512 = 8225280 bytes
Disk identifier: 0x420df78b

デバイス Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sda1   *           1        9658    77577853+   7  HPFS/NTFS
/dev/sda2            9659       19458    78713019    f  W95 Ext'd (LBA)
/dev/sda5            9659       19052    75457273+  83  Linux
/dev/sda6           19053       19457     3253131   82  Linux swap / Solaris
masayukiya@masa2:~$

****
# menu.lst - See: grub(8), info grub, update-grub(8)
#            grub-install(8), grub-floppy(8),
#            grub-md5-crypt, /usr/share/doc/grub
#            and /usr/share/doc/grub-doc/.

## default num
# Set the default entry to the entry number NUM. Numbering starts from 0, and
# the entry number 0 is the default if the command is not used.
#
# You can specify 'saved' instead of a number. In this case, the default entry
# is the entry saved with the command 'savedefault'.
# WARNING: If you are using dmraid do not use 'savedefault' or your
# array will desync and will not let you boot your system.
default        0

## timeout sec
# Set a timeout, in SEC seconds, before automatically booting the default entry
# (normally the first entry defined).
timeout        10

## hiddenmenu
# Hides the menu by default (press ESC to see the menu)
#hiddenmenu

# Pretty colours
#color cyan/blue white/blue

## password ['--md5'] passwd
# If used in the first section of a menu file, disable all interactive editing
# control (menu entry editor and command-line)  and entries protected by the
# command 'lock'
# e.g. password topsecret
#      password --md5 $1$gLhU0/$aW78kHK1QfV3P2b2znUoe/
# password topsecret

#
# examples
#
# title        Windows 95/98/NT/2000
# root        (hd0,0)
# makeactive
# chainloader    +1
#
# title        Linux
# root        (hd0,1)
# kernel    /vmlinuz root=/dev/hda2 ro
#

#
# Put static boot stanzas before and/or after AUTOMAGIC KERNEL LIST

### BEGIN AUTOMAGIC KERNELS LIST
## lines between the AUTOMAGIC KERNELS LIST markers will be modified
## by the debian update-grub script except for the default options below

## DO NOT UNCOMMENT THEM, Just edit them to your needs

## ## Start Default Options ##
## default kernel options
## default kernel options for automagic boot options
## If you want special options for specific kernels use kopt_x_y_z
## where x.y.z is kernel version. Minor versions can be omitted.
## e.g. kopt=root=/dev/hda1 ro
##      kopt_2_6_8=root=/dev/hdc1 ro
##      kopt_2_6_8_2_686=root=/dev/hdc2 ro
# kopt=root=UUID=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9 ro

## default grub root device
## e.g. groot=(hd0,0)
# groot=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9

## should update-grub create alternative automagic boot options
## e.g. alternative=true
##      alternative=false
# alternative=true

## should update-grub lock alternative automagic boot options
## e.g. lockalternative=true
##      lockalternative=false
# lockalternative=false

## additional options to use with the default boot option, but not with the
## alternatives
## e.g. defoptions=vga=791 resume=/dev/hda5
# defoptions=quiet splash

## should update-grub lock old automagic boot options
## e.g. lockold=false
##      lockold=true
# lockold=false

## Xen hypervisor options to use with the default Xen boot option
# xenhopt=

## Xen Linux kernel options to use with the default Xen boot option
# xenkopt=console=tty0

## altoption boot targets option
## multiple altoptions lines are allowed
## e.g. altoptions=(extra menu suffix) extra boot options
##      altoptions=(recovery) single
# altoptions=(recovery mode) single

## controls how many kernels should be put into the menu.lst
## only counts the first occurence of a kernel, not the
## alternative kernel options
## e.g. howmany=all
##      howmany=7
# howmany=all

## should update-grub create memtest86 boot option
## e.g. memtest86=true
##      memtest86=false
# memtest86=true

## should update-grub adjust the value of the default booted system
## can be true or false
# updatedefaultentry=false

## should update-grub add savedefault to the default options
## can be true or false
# savedefault=false

## ## End Default Options ##

title        Ubuntu 8.10, kernel 2.6.27-11-generic
uuid        4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9
kernel        /boot/vmlinuz-2.6.27-11-generic root=UUID=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9 ro quiet splash
initrd        /boot/initrd.img-2.6.27-11-generic
quiet

title        Ubuntu 8.10, kernel 2.6.27-11-generic (recovery mode)
uuid        4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9
kernel        /boot/vmlinuz-2.6.27-11-generic root=UUID=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9 ro  single
initrd        /boot/initrd.img-2.6.27-11-generic

title        Ubuntu 8.10, kernel 2.6.27-7-generic
uuid        4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9
kernel        /boot/vmlinuz-2.6.27-7-generic root=UUID=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9 ro quiet splash
initrd        /boot/initrd.img-2.6.27-7-generic
quiet

title        Ubuntu 8.10, kernel 2.6.27-7-generic (recovery mode)
uuid        4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9
kernel        /boot/vmlinuz-2.6.27-7-generic root=UUID=4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9 ro  single
initrd        /boot/initrd.img-2.6.27-7-generic

title        Ubuntu 8.10, memtest86+
uuid        4b17b775-d74b-4345-8340-7f1aab5e72a9
kernel        /boot/memtest86+.bin
quiet

### END DEBIAN AUTOMAGIC KERNELS LIST

# This is a divider, added to separate the menu items below from the Debian
# ones.
title        Other operating systems:
root


# This entry automatically added by the Debian installer for a non-linux OS
# on /dev/sda1
title        Microsoft Windows XP Home Edition
root        (hd0,0)
savedefault
makeactive
chainloader    +1

お世話になります。
下記のように　setup (hd0) のところでエラーになりました。

[ Minimal BASH-like line editing is supported.   For
         the   first   word,  TAB  lists  possible  command
         completions.  Anywhere else TAB lists the possible
         completions of a device/filename. ]

grub> root (hd0,4)
grub> setup (hd0)
Error 17: Cannot mount selected partition
grub>

最後の編集者: masayuki (2009-04-12 20:10:55)

jackalopeさん、
超初心者にお付き合いいただき有難うございました。今回は再度「RAWコピー」でバックアップを取り直すことにしました。
これからもよろしくお願いします。

einundzwanzighundertsechs による投稿:

糸口になるかどうか分かりませんが，grub の shell からディスクがどう見えているか調べることができます．

お世話になります。

コピー元HDDの表示：
Possible partitions are:
   Partition num: 0,  Filesystem type unknown, partition type 0x7
   Partition num: 4,  Filesystem type is ext2fs, partition type 0x83
   Partition num: 5,  Filesystem type unknown, partition type 0x82
コピー先HDDの表示：
grub> geometry (hd0)
drive 0x80: C/H/S = 19457/255/63, The number of sectors = 312581808, /dev/sda
   Partition num: 0,  Filesystem type unknown, partition type 0x7
   Partition num: 5,  Filesystem type is ext2fs, partition type 0x83
   Partition num: 6,  Filesystem type unknown, partition type 0x82
でした。
なお、fdiskの結果も両方とも下記の表示でした。
デバイス Boot      Start         End      Blocks   Id  System
/dev/sda1   *           1        9658    77577853+   7  HPFS/NTFS
/dev/sda2            9659       19458    78713019    f  W95 Ext'd (LBA)
/dev/sda5            9659       19052    75457273+  83  Linux
/dev/sda6           19053       19457     3253131   82  Linux swap / Solaris

einundzwanzighundertsechs による投稿:

コピー元とコピー先でパーティション番号がズレてます．
jackalope さんの #17 の指示で (hd0,4) となっているところを (hd0,5) に変えれば OK ではないでしょうか　・・・

お世話になります。
やってみました。結果は下記：

grub> root (hd0,5)

grub> setup (hd0)
Checking if "/boot/grub/stage1" exists... yes
Checking if "/boot/grub/stage2" exists... yes
Checking if "/boot/grub/e2fs_stage1_5" exists... yes
Running "embed /boot/grub/e2fs_stage1_5 (hd0)"...  16 sectors are embedded.
succeeded
Running "install /boot/grub/stage1 (hd0) (hd0)1+16 p (hd0,5)/boot/grub/stage2
/boot/grub/menu.lst"... failed

Error 12: Invalid device requested

となり、うまくいきませんでした。