通常のインストールでしたら
https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?pid=30377#p30377
が参考になると思います。

スタートアップディスクとして使用されているのでしたら。
$ sudo fdisk -l
でUSBメモリのデバイスファイル名を確認する。
/dev/sdb1   等です。
新規USBメモリが/dev/sdb1だと仮定してすすめますが、端末から
$ sudo syslinux /dev/sdb1
フォルダに一つだけファイルが出来ています。
容量の小さい方のメモリを展開すると同じファイルが一つ有るので、其れ以外を全てコピペして下さい。